|
|
| Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Tacuarembó. Por información adicional contacte bibliotb@tb.inia.org.uy. |
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA Tacuarembó. |
Fecha : |
08/07/2020 |
Actualizado : |
08/07/2020 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
WEBER, M.N.; MOSENA, A.C.S.; DA SILVA, M.S.; CANOVA, R.; DE LORENZO, C.; OLEGÁRIO, J.C.; BUDASZEWSKI, R.F; BAUMBACH, L.F; SOARES, J.F.; SONNE, L.; VARELA, A.P.M.; MAYER, F.Q.; OLIVEIRA, L.G.S.; CANAL, C.W. |
Afiliación : |
M.N. WEBER, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; Laboratório de Microbiologia Molecular, Instituto de Ciências da Saúde, Universidade Feevale, Novo Hamburgo; ANA C. S. MOSENA, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; MARIANA SOARES DA SILVA, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; R. CANOVA, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; CÍNTIA DE LORENZO, Setor de Patologia Veterinária, Faculdade de Veterinária, UFRGS, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; JULIANA C. OLEGÁRIO, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; RENATA DA FONTOURA BUDASZEWKI, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; LETÍCIA F. BAUMBACH, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; JOÃO FÁBIO SOARES, Laboratório Protozoologia e Riquettsioses Vetoriais, Faculdade de Veterinária, UFRGS, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; LUCIANA SONNE, Setor de Patologia Veterinária, Faculdade de Veterinária, UFRGS, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; ANA PAULA MUTERLE VARELA, Laboratório de Biologia Molecular, Centro de Pesquisa em Saúde Animal, Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor (IPVDF), Secretaria da Agricultura, Pecuária eDesenvolvimento Rural do Rio Grande do Sul (SEAPDR-RS), Eldorado do Sul, Rio Grande; FABIANA MAYER, Laboratório de Biologia Molecular, Centro de Pesquisa em Saúde Animal, Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor (IPVDF), Secretaria da Agricultura, Pecuária eDesenvolvimento Rural do Rio Grande do Sul (SEAPDR-RS), Eldorado do Sul, Rio Grande; LUIZ GUSTAVO SCHNEIDER DE OLIVEIRA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay.; CLÁUDIO CANAL, Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil. |
Título : |
Virome of crab-eating (Cerdocyon thous) and pampas foxes (Lycalopex gymnocercus) from southern Brazil and Uruguay. (Research Paper). |
Fecha de publicación : |
2020 |
Fuente / Imprenta : |
Infection, Genetics and Evolution, November 2020, Volume 85, Article number 104421. OPEN ACCESS. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104421 |
DOI : |
10.1016/j.meegid.2020.104421 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received 21 February 2020, Revised 8 June 2020, Accepted 11 June 2020, Available online 21 June 2020. Acknowledgements: The authors are grateful to Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Finance Code 001, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS) and Reitoria de Pesquisa (PROPESQ-UFRGS) for supporting this study. |
Contenido : |
ABSTRACT: Crab-eating (Cerdocyon thous) and Pampas foxes (Lycalopex gymnocercus) are wild canids distributed in South America. Domestic dogs (Canis lupus familiaris) and wild canids may share viral pathogens, including rabies virus (RABV), canine distemper virus (CDV), and canine parvovirus 2 (CPV-2). To characterize the virome of these wild canid species, the present work evaluated the spleen and mesenteric lymph node virome of 17 crab-eating and five Pampas foxes using high-throughput sequencing (HTS). Organ samples were pooled and sequenced using an Illumina MiSeq platform. Additional PCR analyses were performed to identify the frequencies and host origin for each virus detected by HTS. Sequences more closely related to the Paramyxoviridae, Parvoviridae and Anelloviridae families were detected, as well as circular Rep-encoding single-stranded (CRESS) DNA viruses. CDV was found only in crab-eating foxes, whereas CPV-2 was found in both canid species; both viruses were closely related to sequences reported in domestic dogs from southern Brazil. Moreover, the present work reported the detection of canine bocavirus (CBoV) strains that were genetically divergent from CBoV-1 and 2 lineages. Finally, we also characterized CRESS DNA viruses and anelloviruses with marked diversity. The results of this study contribute to the body of knowledge regarding wild canid viruses that can potentially be shared with domestic canids or other species. |
Palabras claves : |
CANID; FOX; HTS; METAGENOMICS; VIRUS; WILDIFE. |
Thesagro : |
VIRUS. |
Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
Marc : |
LEADER 03064naa a2200385 a 4500 001 1061209 005 2020-07-08 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1016/j.meegid.2020.104421$2DOI 100 1 $aWEBER, M.N. 245 $aVirome of crab-eating (Cerdocyon thous) and pampas foxes (Lycalopex gymnocercus) from southern Brazil and Uruguay. (Research Paper).$h[electronic resource] 260 $c2020 500 $aArticle history: Received 21 February 2020, Revised 8 June 2020, Accepted 11 June 2020, Available online 21 June 2020. Acknowledgements: The authors are grateful to Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Finance Code 001, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS) and Reitoria de Pesquisa (PROPESQ-UFRGS) for supporting this study. 520 $aABSTRACT: Crab-eating (Cerdocyon thous) and Pampas foxes (Lycalopex gymnocercus) are wild canids distributed in South America. Domestic dogs (Canis lupus familiaris) and wild canids may share viral pathogens, including rabies virus (RABV), canine distemper virus (CDV), and canine parvovirus 2 (CPV-2). To characterize the virome of these wild canid species, the present work evaluated the spleen and mesenteric lymph node virome of 17 crab-eating and five Pampas foxes using high-throughput sequencing (HTS). Organ samples were pooled and sequenced using an Illumina MiSeq platform. Additional PCR analyses were performed to identify the frequencies and host origin for each virus detected by HTS. Sequences more closely related to the Paramyxoviridae, Parvoviridae and Anelloviridae families were detected, as well as circular Rep-encoding single-stranded (CRESS) DNA viruses. CDV was found only in crab-eating foxes, whereas CPV-2 was found in both canid species; both viruses were closely related to sequences reported in domestic dogs from southern Brazil. Moreover, the present work reported the detection of canine bocavirus (CBoV) strains that were genetically divergent from CBoV-1 and 2 lineages. Finally, we also characterized CRESS DNA viruses and anelloviruses with marked diversity. The results of this study contribute to the body of knowledge regarding wild canid viruses that can potentially be shared with domestic canids or other species. 650 $aVIRUS 653 $aCANID 653 $aFOX 653 $aHTS 653 $aMETAGENOMICS 653 $aVIRUS 653 $aWILDIFE 700 1 $aMOSENA, A.C.S. 700 1 $aDA SILVA, M.S. 700 1 $aCANOVA, R. 700 1 $aDE LORENZO, C. 700 1 $aOLEGÁRIO, J.C. 700 1 $aBUDASZEWSKI, R.F 700 1 $aBAUMBACH, L.F 700 1 $aSOARES, J.F. 700 1 $aSONNE, L. 700 1 $aVARELA, A.P.M. 700 1 $aMAYER, F.Q. 700 1 $aOLIVEIRA, L.G.S. 700 1 $aCANAL, C.W. 773 $tInfection, Genetics and Evolution, November 2020, Volume 85, Article number 104421. OPEN ACCESS. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104421
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA Tacuarembó (TBO) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
|
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
Fecha actual : |
21/02/2014 |
Actualizado : |
23/04/2018 |
Tipo de producción científica : |
Documentos |
Autor : |
COZZOLINO, D.; CORBELLA, E.; RAMALLO, G.; MAIDANA, M. |
Afiliación : |
DANIEL COZZOLINO GÓMEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; EDUARDO DANIEL CORBELLA GONZALEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; GUSTAVO NOEL RAMALLO MEDINA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARCELO MIGUEL MAIDANA CORREA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
Título : |
Calidad y espectrofometría de reflectancia en el infrarojo cercano de mieles de Uruguay. |
Fecha de publicación : |
2002 |
Fuente / Imprenta : |
La Estanzuela, Colonia: INIA, 2002. |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
Introducción:
La espectrofotometría de reflectancia en el infrarrojo cercano (NIRS) se emplea desde la década del 70 en la industria alimenticia, farmacéutica, petroquímica, como alternativa a los métodos químicos y químico-biológicos tradicionales. Es una técnica rápida, no destructiva ni contaminante, de gran exactitud siempre que se sigan los procedimientos adecuados para crear las ecuaciones de calibración (1, 2). En los últimos años se desarrollaron numerosas aplicaciones de NIRS para evaluar la composición, monitorear el procesamiento y certificar la calidad de alimentos tanto para animales, como para la población humana (1).
NIRS se desempeña entre los 700 y 2500 nanómetros (nm) de longitud de onda del espectro electromagnético. Este método se basa en que cuando la luz incide sobre una muestra, una parte de los fotones es transmitida a través de la misma, siendo el resto absorbido. La absorción de energía hace que los enlaces entre Carbono e Hidrógeno, Oxígeno e Hidrógeno y Nitrógeno e Hidrógeno; componentes principales de la estructura básica de las sustancias orgánicas; vibren en distintas formas (1). La interacción de la energía con la materia obedece a la ley de Beer-Lambert, que establece que la absorbancia a cualquier longitud de onda es proporcional al numero o concentración de moléculas absorbentes presentes en el camino recorrido por la radiación (2). Esto determina que para un material de naturaleza química heterogénea, como es el caso de la miel, el espectro obtenido en la región del infrarrojo cercano sea una combinación de bandas de absorciones parciales sobrepuestas o muy cercanas, que suelen confundirse en una línea suavizada en que se encuentran picos, valles y curvaturas en forma de hombro. Esta información cobra sentido cuando se puede interpretar con la ayuda de una computadora (Figura 1). Al desarrollar una calibración NIRS, se relaciona la información espectral con la información de la composición físico-química, definiendo el tratamiento matemático de los datos, el segmento del espectro a incluir y los métodos de regresión a emplear. De estos últimos, los más utilizados para analizar los datos de laboratorio y los espectrales son la regresión múltiple, los componentes principales y los cuadrados mínimos parciales (1, 2).
Los objetivos el presente trabajo fueron: a) determinar algunos indicadores de calidad de mieles de Uruguay correspondientes a la última zafra apícola. b) estudiar el potencial uso de NIRS para el análisis de miel y c) construir ecuaciones de calibración entre la información físico-química y de NIRS para el análisis rápido de muestras de miel. MenosIntroducción:
La espectrofotometría de reflectancia en el infrarrojo cercano (NIRS) se emplea desde la década del 70 en la industria alimenticia, farmacéutica, petroquímica, como alternativa a los métodos químicos y químico-biológicos tradicionales. Es una técnica rápida, no destructiva ni contaminante, de gran exactitud siempre que se sigan los procedimientos adecuados para crear las ecuaciones de calibración (1, 2). En los últimos años se desarrollaron numerosas aplicaciones de NIRS para evaluar la composición, monitorear el procesamiento y certificar la calidad de alimentos tanto para animales, como para la población humana (1).
NIRS se desempeña entre los 700 y 2500 nanómetros (nm) de longitud de onda del espectro electromagnético. Este método se basa en que cuando la luz incide sobre una muestra, una parte de los fotones es transmitida a través de la misma, siendo el resto absorbido. La absorción de energía hace que los enlaces entre Carbono e Hidrógeno, Oxígeno e Hidrógeno y Nitrógeno e Hidrógeno; componentes principales de la estructura básica de las sustancias orgánicas; vibren en distintas formas (1). La interacción de la energía con la materia obedece a la ley de Beer-Lambert, que establece que la absorbancia a cualquier longitud de onda es proporcional al numero o concentración de moléculas absorbentes presentes en el camino recorrido por la radiación (2). Esto determina que para un material de naturaleza química heterogénea, como es el caso de la miel, el espect... Presentar Todo |
Thesagro : |
ESPECTROMETRIA; MIELES; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
-- |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/9369/1/UY.INIA.Apicultura-cozzolino-et-al.pdf
|
Marc : |
LEADER 03190nam a2200181 a 4500 001 1041451 005 2018-04-23 008 2002 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCOZZOLINO, D. 245 $aCalidad y espectrofometría de reflectancia en el infrarojo cercano de mieles de Uruguay. 260 $aLa Estanzuela, Colonia: INIA$c2002 520 $aIntroducción: La espectrofotometría de reflectancia en el infrarrojo cercano (NIRS) se emplea desde la década del 70 en la industria alimenticia, farmacéutica, petroquímica, como alternativa a los métodos químicos y químico-biológicos tradicionales. Es una técnica rápida, no destructiva ni contaminante, de gran exactitud siempre que se sigan los procedimientos adecuados para crear las ecuaciones de calibración (1, 2). En los últimos años se desarrollaron numerosas aplicaciones de NIRS para evaluar la composición, monitorear el procesamiento y certificar la calidad de alimentos tanto para animales, como para la población humana (1). NIRS se desempeña entre los 700 y 2500 nanómetros (nm) de longitud de onda del espectro electromagnético. Este método se basa en que cuando la luz incide sobre una muestra, una parte de los fotones es transmitida a través de la misma, siendo el resto absorbido. La absorción de energía hace que los enlaces entre Carbono e Hidrógeno, Oxígeno e Hidrógeno y Nitrógeno e Hidrógeno; componentes principales de la estructura básica de las sustancias orgánicas; vibren en distintas formas (1). La interacción de la energía con la materia obedece a la ley de Beer-Lambert, que establece que la absorbancia a cualquier longitud de onda es proporcional al numero o concentración de moléculas absorbentes presentes en el camino recorrido por la radiación (2). Esto determina que para un material de naturaleza química heterogénea, como es el caso de la miel, el espectro obtenido en la región del infrarrojo cercano sea una combinación de bandas de absorciones parciales sobrepuestas o muy cercanas, que suelen confundirse en una línea suavizada en que se encuentran picos, valles y curvaturas en forma de hombro. Esta información cobra sentido cuando se puede interpretar con la ayuda de una computadora (Figura 1). Al desarrollar una calibración NIRS, se relaciona la información espectral con la información de la composición físico-química, definiendo el tratamiento matemático de los datos, el segmento del espectro a incluir y los métodos de regresión a emplear. De estos últimos, los más utilizados para analizar los datos de laboratorio y los espectrales son la regresión múltiple, los componentes principales y los cuadrados mínimos parciales (1, 2). Los objetivos el presente trabajo fueron: a) determinar algunos indicadores de calidad de mieles de Uruguay correspondientes a la última zafra apícola. b) estudiar el potencial uso de NIRS para el análisis de miel y c) construir ecuaciones de calibración entre la información físico-química y de NIRS para el análisis rápido de muestras de miel. 650 $aESPECTROMETRIA 650 $aMIELES 650 $aURUGUAY 700 1 $aCORBELLA, E. 700 1 $aRAMALLO, G. 700 1 $aMAIDANA, M.
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA La Estanzuela (LE) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
Expresión de búsqueda válido. Check! |
|
|