|
|
| Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
27/04/2021 |
Actualizado : |
27/04/2021 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
SIMEONE, M.; GÓMEZ, C.; BERTALMIO, A.; RUIZ, E.; HAUTEVILLE, C.; GODOY, L.; TITO, B.; GARCÍA, M.L. |
Afiliación : |
MELINA SIMEONE, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT-La Plata CONICET-UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIO GÓMEZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ESPERANZA RUIZ, Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIA HAUTEVILLE, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; LAURA GODOY SUÁREZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; BLAS TITO, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; MARÍA L. GARCÍA, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT?La Plata CONICET?UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina. |
Título : |
Detection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters. |
Fecha de publicación : |
2021 |
Fuente / Imprenta : |
Plant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341 |
ISSN : |
0032-0862 |
DOI : |
10.1111/ppa.13341 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021.
This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees.
© 2021 British Society for Plant Pathology |
Palabras claves : |
Citrus psorosis virus; Diagnostic parameters; RT-qPCR. |
Asunto categoría : |
H20 Enfermedades de las plantas |
Marc : |
LEADER 03027naa a2200277 a 4500 001 1061995 005 2021-04-27 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0032-0862 024 7 $a10.1111/ppa.13341$2DOI 100 1 $aSIMEONE, M. 245 $aDetection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters.$h[electronic resource] 260 $c2021 500 $aArticle history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021. This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. 520 $aABSTRACT. Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees. © 2021 British Society for Plant Pathology 653 $aCitrus psorosis virus 653 $aDiagnostic parameters 653 $aRT-qPCR 700 1 $aGÓMEZ, C. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aRUIZ, E. 700 1 $aHAUTEVILLE, C. 700 1 $aGODOY, L. 700 1 $aTITO, B. 700 1 $aGARCÍA, M.L. 773 $tPlant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
|
Registros recuperados : 24 | |
1. | | GIL, A. Manejo de los rodeos de cría de bovinos para carne en el Uruguay. ln: INIA TACUAREMBÓ. INIA TREINTA Y TRES. PROGRAMA NACIONAL OVINOS Y CAPRINOS. PROGRAMA NACIONAL BOVINOS PARA CARNE. Seminario de Actualización Técnica sobre Cría y Recría Ovina y Vacuna, Tacuarembó, 2002. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2002. p. 71-80 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 288)Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
| |
9. | | Bonino, J.Casaretto, A.Mederos, A.Ferreira, G.Gil, A. Relevamiento epidemiológico de la prevalencia de footrot en ovinos del Uruguay ln: Mederos, A.; Ferreira, G.; Montossi, F.; Bonino, J.; Casaretto, A.; Scremini, P.; Gil, A. Estudios sobre footrot ovino en el Uruguay: relevamiento de su prevalencia, evaluación de las pérdidas productivas y económicas. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2001. p. 1-8 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 274)Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
11. | | BONINO, J.; CASARETTO, A.; MEDEROS, A.; FERREIRA, G.; GIL, A. Relevamiento epidemiológico de la prevalencia de footrot en ovinos del Uruguay ln: Bemhaja, M.; Pittaluga, O., eds. 30 años de investigación en suelos de areniscas, INIA Tacuarembó. Montevideo (Uruguay): INIA, 2006. p. 195-205 (INIA Serie Técnica ; 159)Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
13. | | HUERTAS, S.; PIAGGIO, J.; GIL, A.; CÉSAR, D.; DE TORRES, E. Bienestar animal en bovinos lecheros Montevideo (UY): INIA, 2013. 56 p. (Serie FPTA-INIA; 51) Proyecto FPTA 244. Evaluación del bienestar animalen la productividad de bovinos lecheros. Período de Ejecución: Mar. 2007-Feb. 2010.
Integrantes del Equipo de trabajo que apoyaron las diferentes etapas del proyecto : Virginia Artegoitia,...Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas. |
| |
15. | | NAVAS, R.; MONETTA, A.; ROEL, A.; BLANCO, N.; GIL, A.; GAMAZO, P. Flume calibration on irrigated systems by video image processing and bayesian inference. [Calibración de canales aforadores en sistemas irrigados mediante el procesamiento de imágenes de video y la inferencia bayesiana.]. [Calibração de calhas da vazão em sistemas irrigados por processamento de imagens de vídeo e inferência bayesiana.]. Advances in Water in Agroscience. Integrated catchment management. Agrociencia Uruguay, 2023, Vol.27(NE1), e1182. https://doi.org/10.31285/AGRO.27.1182 -- OPEN ACCESS. Article history: Received 22 April 2023; Accepted 17 August 2023; Published 06 February 2024. -- Editor: Ángela Gorgoglione, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay. -- Correspondence: Rafael Navas, rafaelnavas23@gmail.com --...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Nacionales | Circulación / Nivel : Nacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
| |
16. | | DE LOS SANTOS, R.; ZUNINO, P.; GONZÁLEZ REVELLO, A.; GIL, A.; CAL, K.; HIRIGOYEN, D. Producción de biofilms de Stahylococcus aureus aislados de leche en tres medios de cultivo. Carnes & Alimentos: La revista de carnes y alimentos del Uruguay, v. 17, n.57, p.18-22,2016.Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
| |
17. | | SCHILD, C.; CAFFARENA, D.; GIL, A.; SANCHEZ, J.; RIET-CORREA, F.; GIANNITTI, F. A survey of management practices that influence calf welfare and an estimation of the annual calf mortality risk in pastured dairy herds in Uruguay. Journal of Dairy Science, Volume 103, Issue 10, pag. 9418-9429, October 2020. Doi: https://doi.org/10.3168/jds.2020-18177 Article history: Received January 8, 2020/Accepted May 26, 2020. Corresponding authors: cschild@inia.org.uy
and fgiannitti@inia.org.uy.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
| |
19. | | DE LOS SANTOS, R.; GONZÁLEZ-REVELLO, Á.; MAJUL, L.; UMPIÉRREZ, A.; ALDROVANDI, A.; GIL, A.; HIRIGOYEN, D.; ZUNINO, P. Subclinical bovine mastitis associated with Staphylococcusspp. in eleven Uruguayan dairy farms. Journal of Infection in Developing Countries, April 2022, Volume 16, Issue 4, Pages 630-637. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.3855/jidc.12960 Article history: Received 05 May 2020; Accepted 11 February 2022. -- Corresponding author: de los Santos, R.; Departamento de Ciencia y Tecnología de la Leche, Facultad de Veterinaria, UdelaR Lasplaces 1550, Montevideo, Uruguay;...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
| |
20. | | HUERTAS, S.; BOBADILLA, P.; BUENO, H.; CÉSAR, D.; VILA, F.; PIAGGIO, J.; GIL, A.; CALLERO, J.L.; AKKERMANS VAN DER LAAR, E. Evaluación de la sustentabilidad de los sistemas productivos silvopastoriles y sistemas forestales existentes en el país y su relación con la producción de bovinos de carne. Montevideo (UY): INIA, 2020. 63 p. (Serie FPTA-INIA; 87) Proyecto FPTA 311: "Evaluación de la sustentabilidad de los sistemas productivos silvopastoriles y sistemas forestales existentes en el país y su relación con la producción de bovinos de carne." Período de ejecución: Junio 2014 -...Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
| |
Registros recuperados : 24 | |
|
Expresión de búsqueda válido. Check! |
|
|