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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
11/08/2016 |
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Actualizado : |
12/03/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
ROCHA, C.M.L.; VELLICCE, G.R.; GARCÍA, M.G.; PARDO, E.M.; RACEDO, J.; PERERA, M.F.; DE LUCÍA, A.; BONNECARRERE, M.; GERMAN, S.; MARCELINO, F.; LEDESMA, F.; REZNIKOV, S.; PLOPER, D.L.; WELIN, B.; CASTAGNARO, A.P. |
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Afiliación : |
CARLA MARÍA LOURDES ROCHA, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; GABRIEL RICARDO VELLICCE, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; MARÍA GABRIELA GARCÍA, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ESTEBAN MARIANO PARDO, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; JOSEFINA RACEDO, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; MARÍA FRANCISCA PERERA, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ADRIÁN DE LUCÍA, INTA (Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria) - Cerro Azul; MARIA VICTORIA BONNECARRERE MARTINEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA ELISA GERMAN FAEDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FRANCISMAR MARCELINO, EMBRAPA Soja; FRANCISCO LEDESMA, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; SEBASTIÁN REZNIKOV, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; LEONARDO DANIEL PLOPER, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; BJORN WELIN, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ATILIO PEDRO CASTAGNARO, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. |
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Título : |
Use of AFLP markers to estimate molecular diversity of Phakopsora pachyrhizi. |
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Fecha de publicación : |
2015 |
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Fuente / Imprenta : |
Electronic Journal of Biotechnology, 2015, v. 18, no. 6, p. 439-444. OPEN ACCESS. |
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DOI : |
10.1016/j.ejbt.2015.06.007 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 24 April 2015. Accepted 23 September 2015. Available online 28 October 2015. |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919
markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies.
© 2015 Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. Production and hosting by Elsevier B.V. All rights reserve MenosABSTRACT.
Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919
markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an impor... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
ASIAN SOYBEAN RUST; GENETIC VARIATION; GLYCINE MAX; MOLECULAR MARKERS. |
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Thesagro : |
MARCADORES MOLECULARES; SOJA; VARIACION GENETICA. |
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Asunto categoría : |
-- |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5850/1/Rocha-C.M.-2015.-Electr.Jr.Biotech.-v18-p.439-444.pdf
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Marc : |
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260 $c2015
500 $aArticle history: Received 24 April 2015. Accepted 23 September 2015. Available online 28 October 2015.
520 $aABSTRACT. Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies. © 2015 Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. Production and hosting by Elsevier B.V. All rights reserve
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INIA Las Brujas (LB) |
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| 1. |  | KASPARY, T. E.; KAVANOVÁ, M.; CABRERA, M.; GARCIA, A. Amaranthus hybridus en Uruguay: elevado nivel de resistencia a glifosato y presencia de la mutación TAP-IVS. [abstract] En: Congreso Argentino de Malezas, IV - ASACIM, MALEZAS 2023 "Ciencia, producción y sociedad: hacia un manejo sustentable", 14-15 setiembre 2023, Mar del Plata - Buenos Aires, Argentina. Financiación: INIA.| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 4. | | KAVANOVÁ, M.; GARCIA, A.; FRESIA, P.; CONDON, F.; KASPARY, T. E.; CASTILLO, A.; DO CANTO, J. Múltiples orígenes de la resistencia a glifosato en las poblaciones de raigrás anual en la región. In: Sociedad Uruguaya de Fitopatología Jornada Uruguaya de Fitopatología, 6., Jornada Uruguaya de Protección Vegetal, 4., 21-22 octubre, 2021, Montevideo, Uruguay. Libro de resúmenes. Montevideo (UY): Sociedad Uruguay de Fitopatología (SUFIT), 2021. p. 80 Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación e Innovación (FMV_3_2018_1_148682)| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
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| 5. | | KAVANOVÁ, M.; GARCIA, A.; CONDON, F.; FRESSIA, P.; KASPARY, T. E.; CASTILLO, A.; DO CANTO, J. Múltiples orígenes de la resistencia a glifosato en las poblaciones de raigrás anual en la región.[Poster]. In: Sociedad Uruguaya de Fitopatología Jornada Uruguaya de Fitopatología, 6., Jornada Uruguaya de Protección Vegetal, 4., 21-22 octubre, 2021, Montevideo, Uruguay. Libro de resúmenes. Montevideo (UY): Sociedad Uruguay de Fitopatología (SUFIT), 2021. Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación e Innovación (FMV_3_2018_1_148682).| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 6. | | DO CANTO, J.; KAVANOVÁ, M.; GARCIA, A.; FRESIA, P.; KASPARY, T. E.; CONDON, F.; CASTILLO, A. Resistencia a glifosato en raigrás anual en Uruguay. ¿La importamos o la generamos en el país? Revista INIA Uruguay, Setiembre 2021, no.66, p. 95-98. (Revista INIA; 66).| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
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| 9. | | CURIN, F.; BALMACEDA, M.; BRACH, A.; CASTRO, M.; KAVANOVÁ, M.; OTERO, A.; ROSETTI, L.; RUIZ, M.; ALFARO, C.; QUINCKE, A.; ZUIL, S.; GONZÁLEZ, F.G. Evaluación de cultivares de trigo contrastantes para tolerancia a deficit hídrico en un amplio rango de ambientes en el cono sur de America. In: IX Congreso Nacional de Calidad de Trigo, 9°; VII Simposio de Cereales de siembra otoño-invernal; III Reunión del Mercosur, 29-30 setiembre 2021, tres arroyos, Provincia de Buenos Aires, Argentina: La Chacra Experimental Integrada Barrow, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Centro Regional de Ingenieros Agrónomos de Tres Arroyos (CRIATA), Centro Regional de Estudios Superiores de Tres Arroyos (CRESTA).Modalidad Virtual.| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 10. | | DO CANTO, J.; KAVANOVÁ, M.; GARCÍA, M.A.; DE AVILA, L.A.; FRESIA, P.; TUESCA, D.H.; CONDON, F.; GAINES, T. Proyecto: Resistencia a glifosato en raigrás anual en Uruguay-entender, reducir y prevenir- [Resumen] In: REDBIO; INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); REDBIO Argentina. X Encuentro Latinoamericano y del Caribe de Biotecnología Agropecuaria y XI Simposio Redbio Argentina. Libro de Resúmenes. Montevideo 12 - 15 Noviembre 2019. Montevideo (UY): INIA, 2019. p. 76. (INIA Serie Técnica; 253)| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
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| 11. | | BARAIBAR, S.; GARCIA, R.; SILVA, P.; LADO, B.; CASTRO, A.; GUTIÉRREZ , L.; KAVANOVÁ, M.; QUINCKE, M.; BHAVANI , S.; RANDHAWA, M.S.; GERMAN, S. QTL of resistance to Ug99 and other stem rust pathogen races in bread wheat. Molecular Breeding, 1 August 2020, Volume 40, Issue 8, Article number 82. DOI: https://doi.org/10.1007/s11032-020-01153-5 Article history: Received 26 June 2019/ Accepted 23 October 2019/ Published 15 August 2020.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 12. | | BERGER, A.; BONNECARRERE, V.; BORSANI, O.; CASARETTO, E.; CASTILLO, A.; CASTRO, A.; CERETTA, S.; FLEITAS, L.; GALLINO, J.P.; GARAYCOCHEA, S.; IRIARTE, W.; KAVANOVÁ, M.; QUERO, G.; REY, E.; RUIBAL, C.; SIMONDI, S.; VIDAL, S. Aproximaciones genómicas, fisiológicas y de mejoramiento para incrementar la tolerancia a sequía en soja. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Biotecnología. Jornada de Agrobiotecnología, X. Encuentro Nacional de REDBIO, II. Jornada técnica. Las Brujas, Canelones (UY): INIA, 2017. (Serie Actividades de Difusión; 780)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 13. | | SEVERINI, A. D.; KAVANOVÁ, M.; CERETTA, S.; ÁLVAREZ PRADO, S.; FERNÁNDEZ LONG, M. E.; CRESPO, A.; OTEGUI, M. E.; VEGA, C. R. C.; SUIL, S.; ACRECHE, M.; SCHOLZ DRODOWSKI, R. F.; SERRAGO, R. A.; MIRALLES, D. J. CRONOSOJA UY: un nuevo modelo de predicción fenológica para el cultivo de soja en Uruguay. Revista INIA Uruguay, Setiembre 2021, no.66, p. 82-85. (Revista INIA; 66).| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
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