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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA La Estanzuela. Por información adicional contacte bib_le@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
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Fecha : |
21/02/2014 |
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Actualizado : |
26/02/2018 |
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Tipo de producción científica : |
Trabajos en Congresos/Conferencias |
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Autor : |
CASTRO, A.; GERMAN, S.; GONZÁLEZ, S.N.; HAYES, P.M.; PEREYRA, S.; PEREZ, C. |
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Afiliación : |
EEMAC, Facultad de Agronomía, UdelaR, Paysandú, Uruguay.; SILVIA ELISA GERMAN FAEDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVANA NOEMI GONZALEZ PARODI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Barley project, Department of Crop and Soil Sciences, Oregon State University, Corvallis OR 97331, USA.; SILVIA ANTONIA PEREYRA CORREA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; EEMAC, Facultad de Agronomía, UdelaR, Paysandú, Uruguay. |
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Título : |
QTL analysis of spot blotch and leaf rust resistance in the BCD47 × Baronesse barley mapping population. |
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Fecha de publicación : |
2008 |
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Fuente / Imprenta : |
International Barley Genetics Symposium,10.,Alexandria, Egypt: ICARDA, Proceedings, 2008. |
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Páginas : |
p. 311-319. |
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Idioma : |
Inglés |
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Contenido : |
Abstract
Leaf rust (LR) (caused by Puccinia hordei) and spot blotch (SB) (caused by Cochliobolus
sativus) are two of the main diseases of barley in Uruguay. We studied the genetics
of the resistance to both diseases present in a doubled-haploid (DH) population derived
from the cross BCD47 × Baronesse. BCD47 has low SB severity and high susceptibility to
LR, while Baronesse is susceptible to SB and has low susceptibility to LR. Both resistances
were expressed at the adult plant stage. The population was phenotyped in 9 environments
for each disease. Four QTLs were detected for SB, on chromosomes 1H, 3H, 6H and
7H. In three of them, BCD47 contributed the resistant alleles. The QTLs on chromosome
1H (located in the Bmac213-Bmag770 interval) and chromosome 3H (located in the
Bmag225-Bmag013 interval) were the most consistent across environments. Two main
QTLs were detected for LR on chromosomes 6H (Baronesse contributing the resistant
allele) and 7H (BCD47 contributing the resistant allele), coincident with SB
resistance QTLs. The QTL on chromosome 6H (linked to the SSR Bmag173) was the
most consistent across environments. |
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Palabras claves : |
RESISTENCIA A LA ROYA DE LA HOJA. |
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Thesagro : |
CEBADA; ROYA. |
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Asunto categoría : |
H20 Enfermedades de las plantas |
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Marc : |
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520 $aAbstract Leaf rust (LR) (caused by Puccinia hordei) and spot blotch (SB) (caused by Cochliobolus sativus) are two of the main diseases of barley in Uruguay. We studied the genetics of the resistance to both diseases present in a doubled-haploid (DH) population derived from the cross BCD47 × Baronesse. BCD47 has low SB severity and high susceptibility to LR, while Baronesse is susceptible to SB and has low susceptibility to LR. Both resistances were expressed at the adult plant stage. The population was phenotyped in 9 environments for each disease. Four QTLs were detected for SB, on chromosomes 1H, 3H, 6H and 7H. In three of them, BCD47 contributed the resistant alleles. The QTLs on chromosome 1H (located in the Bmac213-Bmag770 interval) and chromosome 3H (located in the Bmag225-Bmag013 interval) were the most consistent across environments. Two main QTLs were detected for LR on chromosomes 6H (Baronesse contributing the resistant allele) and 7H (BCD47 contributing the resistant allele), coincident with SB resistance QTLs. The QTL on chromosome 6H (linked to the SSR Bmag173) was the most consistent across environments.
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773 $tInternational Barley Genetics Symposium,10.,Alexandria, Egypt: ICARDA, Proceedings, 2008.
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Registro original : |
INIA La Estanzuela (LE) |
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Biblioteca
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Identificación
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Origen
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas. |
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Fecha actual : |
10/09/2014 |
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Actualizado : |
06/11/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Circulación / Nivel : |
B - 2 |
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Autor : |
BRANDA, A.; RAVAGNOLO, O.; BRITO, G.; BALDI, F.; LA MANNA, A.; BANCHERO, G.; NAVAJAS, E.; RINCON, G.; MEDRANO, J.F. |
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Afiliación : |
ANDREA BRANDA SICA, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; OLGA RAVAGNOLO GUMILA, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; GUSTAVO WALTER BRITO DIAZ, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; ALEJANDRO FRANCISCO LA MANNA ALONSO, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; GEORGGET ELIZABETH BANCHERO HUNZIKER, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; ELLY ANA NAVAJAS VALENTINI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Evaluation of panel SNP in metabolic pathways candidate genes for meat in hereford. [Evaluación de panel SNP en genes candidatos de vías metabólicas para carne en hereford.] |
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Fecha de publicación : |
2014 |
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Fuente / Imprenta : |
Archivos de Zootecnia, 2014, v.63, no.241, p.73-84. OPEN ACCESS |
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ISSN : |
0004-0592 |
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DOI : |
10.4321/S0004-05922014000100008 |
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Idioma : |
Español |
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Notas : |
Article history: Recibido 12 noviembre 2012 // Aceptado 25 setiembre 2013. |
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Contenido : |
RESUMEN.
Se realizó una validación preliminar de un panel de marcadores SNP seleccionados de genes candidatos, relacionados al eje endócrino que regulan la hormona de crecimiento GH/IGF1, y a la formación y desaturación de ácidos grasos SCD/SREBP1, con características de composición de canal, calidad de carne y perfil de ácidos grasos de la grasa intramuscular en novillos Hereford sometidos a diferentes tratamientos de alimentación durante la etapa de recría y engorde intensivo. Se ajustaron las variables por el efecto de los 8 tratamientos nutricionales y se calcularon los valores residuales para los análisis de asociación con los marcadores SNP. Se determinó un total de 11 696 genotipos de 237 novillos utilizando un panel de 58 tag-SNP en los genes GHR, IGF1, IGFBP6, PMCH, SOCS2, STAT6, SCD1, SCD5, SREBP1, SCAP, INSIG1, INSIG2, MBTPS1, MBTPS2 y SRPR, de los cuales se encontraron 11 SNP polimórficos que estuvieron asociados signifi-cativamente: GHR_ rs41639262 sobre EGSu y MARBL; IGF1_ rs136251088 sobre PCC, PCE y PISTOLA; PMCH_ rs135033882 sobre OMEGA36; SOCS2_ ss252841026 sobre Terneza2d; STAT6_ rs109171041 sobre Terneza2d; STAT6_ rs110097583 sobre Terneza2d; INSIG1_ rs109314460 sobre Terneza21d; INSIG1_ ss252452220 sobre OMEGA36; SCD5_ ss252452202 sobre PUFA y Terneza2d; SCD5_ rs43687655 sobre EGSu y OMEGA36; SRPR_ rs42178091 sobre GRASAINTR, SFA, MUFA, PCC, PCE y PISTOLA. Estudios adicionales podrían confirmar estos efectos, posibilitando mejorar la calidad de la canal y de la carne, de animales sometidos a diferentes tratamientos de alimentación a través de la selección.
SUMMARY.
The phenotype-genotype associations of a panel of SNP markers selected from candidate genes related to the growth hormone GH/IGF1endocrine axis and the fatty acid synthesis and desaturation SCD/SREBP1 pathways, were examined. Phenotypes of interest were carcass composition, meat quality and fatty acid profiles of intramuscular fat in Hereford steers under different feeding treatments during the growth and finishing stages. Variables were adjusted for the effect of eight nutritional treatments and residual values were used in the association analysis with the SNP markers. A total of 11 696 genotypes of 237 steers were determined using a panel of 58 tag-SNP in the GHR, IGF1, IGFBP6, PMCH, SOCS2, STAT6, SCD1, SCD5, SREBP1, SCAP, INSIG1, INSIG2, MBTPS1, MBTPS2 and SRPR genes. A total of 11 polymorphic SNP were significantly asso-ciated with traits of interest: GHR_ rs41639262 on EGSu and MARBL; IGF1_ rs136251088 on PCC, PCE and PISTOLA; PMCH_ rs135033882 on OMEGA36; SOCS2_ ss252841026 on Terneza2d; STAT6_ rs109171041 on Terneza2d; STAT6_ rs110097583 on Terneza2d; INSIG1_ rs109314460 on Terneza21d; INSIG1_ ss252452220 on OMEGA36; SCD5_ ss252452202 on PUFA and Terneza2d; SCD5_ rs43687655 on EGSu and OMEGA36; SRPR_ rs42178091 on GRASAINTR, SFA, MUFA, PCC, PCE and PISTOLA. Additional studies could validate the marker-trait association effects that would make it possible to use these genetic markers to improve carcass and meat quality of animals under different feeding regimes. MenosRESUMEN.
Se realizó una validación preliminar de un panel de marcadores SNP seleccionados de genes candidatos, relacionados al eje endócrino que regulan la hormona de crecimiento GH/IGF1, y a la formación y desaturación de ácidos grasos SCD/SREBP1, con características de composición de canal, calidad de carne y perfil de ácidos grasos de la grasa intramuscular en novillos Hereford sometidos a diferentes tratamientos de alimentación durante la etapa de recría y engorde intensivo. Se ajustaron las variables por el efecto de los 8 tratamientos nutricionales y se calcularon los valores residuales para los análisis de asociación con los marcadores SNP. Se determinó un total de 11 696 genotipos de 237 novillos utilizando un panel de 58 tag-SNP en los genes GHR, IGF1, IGFBP6, PMCH, SOCS2, STAT6, SCD1, SCD5, SREBP1, SCAP, INSIG1, INSIG2, MBTPS1, MBTPS2 y SRPR, de los cuales se encontraron 11 SNP polimórficos que estuvieron asociados signifi-cativamente: GHR_ rs41639262 sobre EGSu y MARBL; IGF1_ rs136251088 sobre PCC, PCE y PISTOLA; PMCH_ rs135033882 sobre OMEGA36; SOCS2_ ss252841026 sobre Terneza2d; STAT6_ rs109171041 sobre Terneza2d; STAT6_ rs110097583 sobre Terneza2d; INSIG1_ rs109314460 sobre Terneza21d; INSIG1_ ss252452220 sobre OMEGA36; SCD5_ ss252452202 sobre PUFA y Terneza2d; SCD5_ rs43687655 sobre EGSu y OMEGA36; SRPR_ rs42178091 sobre GRASAINTR, SFA, MUFA, PCC, PCE y PISTOLA. Estudios adicionales podrían confirmar estos efectos, posibilitando mejorar la calidad de la canal ... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
BEEF CATTLE; CARCASS COMPOSITION; FATTY ACID PROFILE; MEAT QUALITY. |
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Thesagro : |
CALIDAD DE LA CARNE; COMPOSICIÓN DE LA CANAL; DESTETE PRECOZ; GANADO DE CARNE; HORMONAS; NUTRICIÓN ANIMAL; PERFIL DE ÁCIDOS GRASOS; PUBERTAD. |
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Asunto categoría : |
L01 Ganadería |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/3071/1/Branda-A.-2014-Archivos-Zootecnia-v.63241-p.73-84.pdf
http://www.uco.es/organiza/servicios/publica/az/php/img/web/27_19_11_08_2870EvaluacionBranda.pdf
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Marc : |
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100 1 $aBRANDA, A.
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700 1 $aMEDRANO, J.F.
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