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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
11/12/2018 |
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Actualizado : |
06/02/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
MOTA, R. R.; LOPES, P. S.; TEMPELMAN, R. J.; SILVA, F. F.; AGUILAR, I.; GOMES, C. C. G.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliación : |
R. R. MOTA, Animal Science Department, Federal University of Viçosa, Brazil; P. S. LOPES, Animal Science Department, Federal University of Viçosa, Viçosa, Brazil; R. J. TEMPELMAN, Animal Science Department, Michigan State University, United States; F. F. SILVA, Animal Science Department, Federal University of Viçosa, Brazil; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; C. C. G. GOMES, Embrapa South Livestock, Brazil; F. F. CARDOSO, eAnimal Science Department, Federal University of Pelotas, Brazil. |
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Título : |
Genome-enabled prediction for tick resistance in Hereford and Braford beef cattle via reaction norm models. |
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Fecha de publicación : |
2016 |
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Fuente / Imprenta : |
Journal of Animal Science, May 2016, Volume 94, Issue 5, Pages 1834 - 1843. |
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ISSN : |
0021-8812 |
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DOI : |
10.2527/jas.2015-0194 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received December 11, 2015. // Accepted March 10, 2016. |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Very few studies have been conducted to infer genotype × environment interaction (G×E) based in genomic prediction models using SNP markers. Therefore, our main objective was to compare a conventional genomic-based single-step model (HBLUP) with its reaction norm model extension (genomic 1-step linear reaction norm model [HLRNM]) to provide EBV for tick resistance as well as to compare predictive performance of these models with counterpart models that ignore SNP marker information, that is, a linear animal model (ABLUP) and its reaction norm extension (1-step linear reaction norm model [ALRNM]). Phenotypes included 10,673 tick counts on 4,363 Hereford and Braford animals, of which 3,591 were genotyped. Using the deviance information criterion for model choice, ABLUP and HBLUP seemed to be poorer fitting in comparison with their respective genomic model extensions. The HLRNM estimated lower average and reaction norm genetic variability compared with the ALRNM, whereas ABLUP and HBLUP seemed to be poorer fitting in comparison with their respective genomic reaction norm model extensions. Heritability and repeatability estimates varied along the environmental gradient (EG) and the genetic correlations were remarkably low between high and low EG, indicating the presence of G×E for tick resistance in these populations. Based on 5-fold K-means partitioning, mean cross-validation estimates with their respective SE of predictive accuracy were 0.66 (SE 0.02), 0.67 (SE 0.02), 0.67 (SE 0.02), and 0.66 (SE 0.02) for ABLUP, HBLUP, HLRNM, and ALRNM, respectively. For 5-fold random partitioning, HLRNM (0.71 ± 0.01) was statistically different from ABLUP (0.67 ± 0.01). However, no statistical significance was reported when considering HBLUP (0.70 ± 0.01) and ALRNM (0.70 ± 0.01). Our results suggest that SNP marker information does not lead to higher prediction accuracies in reaction norm models. Furthermore, these accuracies decreased as the tick infestation level increased and as the relationship between animals in training and validation data sets decreased.
© 2016 American Society of Animal Science. All rights reserved. MenosABSTRACT.
Very few studies have been conducted to infer genotype × environment interaction (G×E) based in genomic prediction models using SNP markers. Therefore, our main objective was to compare a conventional genomic-based single-step model (HBLUP) with its reaction norm model extension (genomic 1-step linear reaction norm model [HLRNM]) to provide EBV for tick resistance as well as to compare predictive performance of these models with counterpart models that ignore SNP marker information, that is, a linear animal model (ABLUP) and its reaction norm extension (1-step linear reaction norm model [ALRNM]). Phenotypes included 10,673 tick counts on 4,363 Hereford and Braford animals, of which 3,591 were genotyped. Using the deviance information criterion for model choice, ABLUP and HBLUP seemed to be poorer fitting in comparison with their respective genomic model extensions. The HLRNM estimated lower average and reaction norm genetic variability compared with the ALRNM, whereas ABLUP and HBLUP seemed to be poorer fitting in comparison with their respective genomic reaction norm model extensions. Heritability and repeatability estimates varied along the environmental gradient (EG) and the genetic correlations were remarkably low between high and low EG, indicating the presence of G×E for tick resistance in these populations. Based on 5-fold K-means partitioning, mean cross-validation estimates with their respective SE of predictive accuracy were 0.66 (SE 0.02), 0.67 (SE 0.02)... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
ACCURACY; CROSS-VALIDATION; GENETIC CORRELATION; HERITABILITY. |
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Asunto categoría : |
-- |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/12162/1/mota2016.pdf
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Marc : |
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Esconder MarcPresentar Marc Completo |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Tacuarembó. |
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Fecha actual : |
10/02/2015 |
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Actualizado : |
13/06/2018 |
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Tipo de producción científica : |
Documentos |
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Autor : |
JAURENA, M.; GIORELLO, D.; ANTUNEZ, J.; DIAZ, S.; SOSA, M.; ZAGO, R.; SILVEIRA, J.; SUAREZ, M.; ALBORNOZ, A. |
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Afiliación : |
MARTIN ALEJANDRO JAURENA BARRIOS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO GERMAN GIORELLO LEITES, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JUAN ANGEL ANTUNEZ GAITES, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SAULO SEBASTIAN DIAZ OLIVERA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARTIN OSORIO SOSA PINTADO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODRIGO ZAGO FAGUNDES, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JOSE MAURICIO SILVEIRA PALOMEQUE, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MAXIMO ALDEMAR SUAREZ PEREZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ALFONSO ALBORNOZ PAZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Efectos de la fertilización NP en la producción de forraje del campo natural en condiciones de riego y secano. |
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Fecha de publicación : |
2015 |
|
Fuente / Imprenta : |
In: INIA TACUAREMBÓ. JORNADA DE DIVULGACIÓN, 6 DE FEBRERO, 2015, TAMBORES, URUGUAY. Manejo de la fertilización de pasturas, forrajes y campo natural bajo riego suplementario. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2015. |
|
Páginas : |
p. 9-16 |
|
Serie : |
(Serie Actividades de Difusión; 742) |
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ISSN : |
1688-9258 |
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Idioma : |
Español |
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Contenido : |
Existe un creciente interés por conocer el impacto de la variabilidad climática y la fertilización en la producción y calidad de la pastura de los campos natural en Uruguay. Si bien los campos naturales representan el principal recurso forrajero del país, su sostenibilidad está siendo amenazada por cambios en el uso del suelo y por el sobrepastoreo. La mayor parte de la producción de carne y lana de Uruguay se basa en la utilización de estos campos, los cuales
presentan el inconveniente de su gran fluctuación anual y estacional en la producción y calidad del forraje. En estudios de largo plazo se ha demostrado que la productividad de estas pasturas es afectada por las precipitaciones, por lo cual resultaría muy útil predecir los efectos del riego en la
producción preparándonos para un contexto de mayor variabilidad climática. La escasa profundidad de los suelos de basalto determina un alto riesgo de sequía y de erosión de suelos, proceso que se acelera en campos sobrepastoreados. Para atenuar los impactos de la variabilidad climática en la producción de forraje, una de las opciones tecnológicas para esta región es la implementación de pequeñas áreas de alta producción de forraje. En este sentido la fertilización del campo natural con nitrógeno es una opción estratégica para asegurar una base de alimentación para los animales. En la medida en que el aumento del agua disponible y el
nitrógeno mejoran la capacidad de crecimiento de la pastura, es esperable que el aporte de fósforo del suelo no alcance a cubrir la demanda, necesitando aportes vía fertilización. A partir de estos antecedentes se viene realizando un experimento desde la primavera del año 2011 con el objetivo de conocer los efectos del riego suplementario y la fertilización en la producción y composición de un campo natural de basalto. MenosExiste un creciente interés por conocer el impacto de la variabilidad climática y la fertilización en la producción y calidad de la pastura de los campos natural en Uruguay. Si bien los campos naturales representan el principal recurso forrajero del país, su sostenibilidad está siendo amenazada por cambios en el uso del suelo y por el sobrepastoreo. La mayor parte de la producción de carne y lana de Uruguay se basa en la utilización de estos campos, los cuales
presentan el inconveniente de su gran fluctuación anual y estacional en la producción y calidad del forraje. En estudios de largo plazo se ha demostrado que la productividad de estas pasturas es afectada por las precipitaciones, por lo cual resultaría muy útil predecir los efectos del riego en la
producción preparándonos para un contexto de mayor variabilidad climática. La escasa profundidad de los suelos de basalto determina un alto riesgo de sequía y de erosión de suelos, proceso que se acelera en campos sobrepastoreados. Para atenuar los impactos de la variabilidad climática en la producción de forraje, una de las opciones tecnológicas para esta región es la implementación de pequeñas áreas de alta producción de forraje. En este sentido la fertilización del campo natural con nitrógeno es una opción estratégica para asegurar una base de alimentación para los animales. En la medida en que el aumento del agua disponible ... Presentar Todo |
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Thesagro : |
CAMPO NATURAL; FERTILIZACION; FORRAJE. |
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Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/10224/1/SAD-742p9-16.pdf
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Marc : |
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520 $aExiste un creciente interés por conocer el impacto de la variabilidad climática y la fertilización en la producción y calidad de la pastura de los campos natural en Uruguay. Si bien los campos naturales representan el principal recurso forrajero del país, su sostenibilidad está siendo amenazada por cambios en el uso del suelo y por el sobrepastoreo. La mayor parte de la producción de carne y lana de Uruguay se basa en la utilización de estos campos, los cuales presentan el inconveniente de su gran fluctuación anual y estacional en la producción y calidad del forraje. En estudios de largo plazo se ha demostrado que la productividad de estas pasturas es afectada por las precipitaciones, por lo cual resultaría muy útil predecir los efectos del riego en la producción preparándonos para un contexto de mayor variabilidad climática. La escasa profundidad de los suelos de basalto determina un alto riesgo de sequía y de erosión de suelos, proceso que se acelera en campos sobrepastoreados. Para atenuar los impactos de la variabilidad climática en la producción de forraje, una de las opciones tecnológicas para esta región es la implementación de pequeñas áreas de alta producción de forraje. En este sentido la fertilización del campo natural con nitrógeno es una opción estratégica para asegurar una base de alimentación para los animales. En la medida en que el aumento del agua disponible y el nitrógeno mejoran la capacidad de crecimiento de la pastura, es esperable que el aporte de fósforo del suelo no alcance a cubrir la demanda, necesitando aportes vía fertilización. A partir de estos antecedentes se viene realizando un experimento desde la primavera del año 2011 con el objetivo de conocer los efectos del riego suplementario y la fertilización en la producción y composición de un campo natural de basalto.
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Registro original : |
INIA Tacuarembó (TBO) |
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