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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
06/10/2014 |
Actualizado : |
10/02/2020 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
SIMEONE, R.; MISZTAL, I.; AGUILAR, I.; LEGARRA, A. |
Afiliación : |
IGNACIO AGUILAR GARCIA, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay. |
Título : |
Evaluation of the utility of diagonal elements of the genomic relationship matrix as a diagnostic tool to detect mislabelled genotyped animals in a broiler chicken population. |
Fecha de publicación : |
2011 |
Fuente / Imprenta : |
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2011, v.128, no.5, p.386-393. |
ISSN : |
0931-2668 |
DOI : |
http://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2011.00926.x |
Idioma : |
Inglés |
Contenido : |
ABSTRACT,
This study explored distributions of diagonal elements of genomic relationship matrix (G), evaluated the utility of G as a diagnostic tool to detect mislabelled animals in a genomic dataset and evaluated the effect of mislabelled animals on the accuracy of genomic evaluation. Populations of 10000 animals were simulated with 60000 SNP varying in allele frequency at each locus between 0.02 and 0.98. Diagonal elements of G were distributed with a single peak (mean=1.00±0.03) and ranged from 0.84 through 1.36. Mixed populations were also simulated: 7000 animals with frequencies of second alleles ranging from 0.02 through 0.98 were combined with 1750 or 7000 animals with frequencies of second alleles ranging from 0.0 through 1.0. The resulting distributions of diagonal elements of G were bimodal. Body weight at 6weeks was provided by Cobb-Vantress for broiler chickens, of which 3285 were genotyped for 57636 SNP. Analysis used a combined genomic and pedigree relationship matrix; G was scaled using current allele frequencies. The distribution of diagonal elements was multimodal and ranged from 0.54 to 3.23. Animals with diagonal elements >1.5 were identified as coming from another chicken line or as having low call rates. Removal of mislabelled animals increased accuracy by 0.01. For the studied type of population, diagonal elements of G may be a useful tool to help identify mislabelled animals or secondary populations.
© 2011 Blackwell Verlag GmbH. |
Thesagro : |
GENOTIPOS; MEJORAMIENTO GENÉTICO ANIMAL; MODELOS DE SIMULACIÓN; POLLO; SELECCIÓN DE GENOTIPOS. |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
Marc : |
LEADER 02325naa a2200241 a 4500 001 1050930 005 2020-02-10 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0931-2668 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2011.00926.x$2DOI 100 1 $aSIMEONE, R. 245 $aEvaluation of the utility of diagonal elements of the genomic relationship matrix as a diagnostic tool to detect mislabelled genotyped animals in a broiler chicken population.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aABSTRACT, This study explored distributions of diagonal elements of genomic relationship matrix (G), evaluated the utility of G as a diagnostic tool to detect mislabelled animals in a genomic dataset and evaluated the effect of mislabelled animals on the accuracy of genomic evaluation. Populations of 10000 animals were simulated with 60000 SNP varying in allele frequency at each locus between 0.02 and 0.98. Diagonal elements of G were distributed with a single peak (mean=1.00±0.03) and ranged from 0.84 through 1.36. Mixed populations were also simulated: 7000 animals with frequencies of second alleles ranging from 0.02 through 0.98 were combined with 1750 or 7000 animals with frequencies of second alleles ranging from 0.0 through 1.0. The resulting distributions of diagonal elements of G were bimodal. Body weight at 6weeks was provided by Cobb-Vantress for broiler chickens, of which 3285 were genotyped for 57636 SNP. Analysis used a combined genomic and pedigree relationship matrix; G was scaled using current allele frequencies. The distribution of diagonal elements was multimodal and ranged from 0.54 to 3.23. Animals with diagonal elements >1.5 were identified as coming from another chicken line or as having low call rates. Removal of mislabelled animals increased accuracy by 0.01. For the studied type of population, diagonal elements of G may be a useful tool to help identify mislabelled animals or secondary populations. © 2011 Blackwell Verlag GmbH. 650 $aGENOTIPOS 650 $aMEJORAMIENTO GENÉTICO ANIMAL 650 $aMODELOS DE SIMULACIÓN 650 $aPOLLO 650 $aSELECCIÓN DE GENOTIPOS 700 1 $aMISZTAL, I. 700 1 $aAGUILAR, I. 700 1 $aLEGARRA, A. 773 $tJournal of Animal Breeding and Genetics, 2011$gv.128, no.5, p.386-393.
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Estado
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
Fecha actual : |
25/09/2014 |
Actualizado : |
30/08/2017 |
Tipo de producción científica : |
Presentaciones Orales |
Autor : |
LUIZZI, D.; QUINCKE, M.; GERMAN, S. |
Afiliación : |
MARTIN CONRADO QUINCKE WALDEN, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay; SILVIA ELISA GERMAN FAEDO, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay. |
Título : |
Avances en el mejoramiento de trigo de La Estanzuela. |
Fecha de publicación : |
2014 |
Fuente / Imprenta : |
In: SEMINARIO INTERNACIONAL DE TRIGO, 2014, La Estanzuela, Colonia, UY. GERMÁN, S., et al. (Org.). 1914-2014, un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela: un valioso legado para el futuro: presentaciones; resúmenes. La Estanzuela, Colonia, UY: INIA, 2014. |
Páginas : |
p. 3. |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
Es de fundamental importancia poder analizar el avance genético en las características seleccionadas por el Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) eliminando el efecto del manejo. Citamos dos trabajos que cubren un período de 80 años de liberación de cultivares durante 1918-1997. Los trabajos de referencia ocupan en el tiempo el cambio de una agricultura extractiva hasta el modelo implementado por La Estanzuela de una agricultura sobre la base de un sistema de rotaciones con praderas cuyo objetivo fue el mantener el nivel de productividad de los suelos, conservando y mejorando el nivel de materia orgánica. El PMGT fue adecuándose a los cambios tecnológicos pero era necesario conocer si se estaba mejorando el potencial de rendimiento y calidad molinera/panadera de los materiales que se fueron liberando como alternativas en el mercado de cultivares. En el primer experimento, sembrado en 1978, se compararon los primeros trigos de pedigree liberados en 1918 (Americano 26n y Americano 44d) que tuvieron una gran trayectoria a nivel nacional y regional, los clásicos cultivares que cubrieron un largo período durante 1934 a 1977 (Litoral Precoz y Multiplicación 14), los primeros cultivares introducidos (Estanzuela Sabiá y E. Zorzal) junto al primer cultivar creado por el PMGT posterior a la reorganización del Instituto Fitotécnico y Semillero Nacional (1974, E. Tarariras) y líneas experimentales avanzadas pre-comerciales en 1978. El segundo trabajo fue sembrado por tres años (1994-96) y comparó los cultivares liberados durante 1958-1974 con cultivares posteriores que tuvieron una muy importante participación en el área de siembra como E. Hornero (1981), E. Cardenal (1985), E. Pelón 90 (1990) e INIA Mirlo (1995), entre otros. Los materiales liberados hasta 1974 fueron similares en los dos trabajos. Los materiales se probaron en experimentos fertilizados, para simular los niveles de fertilidad de la segunda etapa, y con control de enfermedades, para eliminar el efecto de las mismas sobre las distintas características evaluadas. Los resultados del primer trabajo indicaron una clara mejoría en el potencial genético de las últimas variedades liberadas (ej. E. Tarariras) y una mejora genética en el valor de sedimentación (>30) que evalúa indirectamente la calidad panadera y molinera. En el segundo trabajo se estimaron incrementos de rendimiento de 59 kg/ha/año. En este trabajo no se encontró una tendencia clara de la evolución del volumen de sedimentación SDS y se observó una disminución de la cantidad de gluten, desde los materiales más antiguos hasta los más nuevos. A los altos niveles de rendimiento de grano logrados, esta reducción no representa ningún peligro desde el punto de vista de calidad industrial, ya que es suficiente para panificación directa. MenosEs de fundamental importancia poder analizar el avance genético en las características seleccionadas por el Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) eliminando el efecto del manejo. Citamos dos trabajos que cubren un período de 80 años de liberación de cultivares durante 1918-1997. Los trabajos de referencia ocupan en el tiempo el cambio de una agricultura extractiva hasta el modelo implementado por La Estanzuela de una agricultura sobre la base de un sistema de rotaciones con praderas cuyo objetivo fue el mantener el nivel de productividad de los suelos, conservando y mejorando el nivel de materia orgánica. El PMGT fue adecuándose a los cambios tecnológicos pero era necesario conocer si se estaba mejorando el potencial de rendimiento y calidad molinera/panadera de los materiales que se fueron liberando como alternativas en el mercado de cultivares. En el primer experimento, sembrado en 1978, se compararon los primeros trigos de pedigree liberados en 1918 (Americano 26n y Americano 44d) que tuvieron una gran trayectoria a nivel nacional y regional, los clásicos cultivares que cubrieron un largo período durante 1934 a 1977 (Litoral Precoz y Multiplicación 14), los primeros cultivares introducidos (Estanzuela Sabiá y E. Zorzal) junto al primer cultivar creado por el PMGT posterior a la reorganización del Instituto Fitotécnico y Semillero Nacional (1974, E. Tarariras) y líneas experimentales avanzadas pre-comerciales en 1978. El segundo trabajo fue sembrado por tres ... Presentar Todo |
Palabras claves : |
AVANCE GENÉTICO; CALIDAD INDUSTRIAL; EFECTO MANEJO; PROGRAMA DE MEJORAMIENTO GENÉTICO DE TRIGO; RENDIMIENTO; TRITICUM AESTIVUM. |
Thesagro : |
CULTIVOS DE INVIERNO; FITOMEJORAMIENTO; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
Marc : |
LEADER 03775nam a2200253 a 4500 001 1050558 005 2017-08-30 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLUIZZI, D. 245 $aAvances en el mejoramiento de trigo de La Estanzuela.$h[electronic resource] 260 $aIn: SEMINARIO INTERNACIONAL DE TRIGO, 2014, La Estanzuela, Colonia, UY. GERMÁN, S., et al. (Org.). 1914-2014, un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela: un valioso legado para el futuro: presentaciones; resúmenes. La Estanzuela, Colonia, UY: INIA$c2014 300 $ap. 3. 520 $aEs de fundamental importancia poder analizar el avance genético en las características seleccionadas por el Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) eliminando el efecto del manejo. Citamos dos trabajos que cubren un período de 80 años de liberación de cultivares durante 1918-1997. Los trabajos de referencia ocupan en el tiempo el cambio de una agricultura extractiva hasta el modelo implementado por La Estanzuela de una agricultura sobre la base de un sistema de rotaciones con praderas cuyo objetivo fue el mantener el nivel de productividad de los suelos, conservando y mejorando el nivel de materia orgánica. El PMGT fue adecuándose a los cambios tecnológicos pero era necesario conocer si se estaba mejorando el potencial de rendimiento y calidad molinera/panadera de los materiales que se fueron liberando como alternativas en el mercado de cultivares. En el primer experimento, sembrado en 1978, se compararon los primeros trigos de pedigree liberados en 1918 (Americano 26n y Americano 44d) que tuvieron una gran trayectoria a nivel nacional y regional, los clásicos cultivares que cubrieron un largo período durante 1934 a 1977 (Litoral Precoz y Multiplicación 14), los primeros cultivares introducidos (Estanzuela Sabiá y E. Zorzal) junto al primer cultivar creado por el PMGT posterior a la reorganización del Instituto Fitotécnico y Semillero Nacional (1974, E. Tarariras) y líneas experimentales avanzadas pre-comerciales en 1978. El segundo trabajo fue sembrado por tres años (1994-96) y comparó los cultivares liberados durante 1958-1974 con cultivares posteriores que tuvieron una muy importante participación en el área de siembra como E. Hornero (1981), E. Cardenal (1985), E. Pelón 90 (1990) e INIA Mirlo (1995), entre otros. Los materiales liberados hasta 1974 fueron similares en los dos trabajos. Los materiales se probaron en experimentos fertilizados, para simular los niveles de fertilidad de la segunda etapa, y con control de enfermedades, para eliminar el efecto de las mismas sobre las distintas características evaluadas. Los resultados del primer trabajo indicaron una clara mejoría en el potencial genético de las últimas variedades liberadas (ej. E. Tarariras) y una mejora genética en el valor de sedimentación (>30) que evalúa indirectamente la calidad panadera y molinera. En el segundo trabajo se estimaron incrementos de rendimiento de 59 kg/ha/año. En este trabajo no se encontró una tendencia clara de la evolución del volumen de sedimentación SDS y se observó una disminución de la cantidad de gluten, desde los materiales más antiguos hasta los más nuevos. A los altos niveles de rendimiento de grano logrados, esta reducción no representa ningún peligro desde el punto de vista de calidad industrial, ya que es suficiente para panificación directa. 650 $aCULTIVOS DE INVIERNO 650 $aFITOMEJORAMIENTO 650 $aURUGUAY 653 $aAVANCE GENÉTICO 653 $aCALIDAD INDUSTRIAL 653 $aEFECTO MANEJO 653 $aPROGRAMA DE MEJORAMIENTO GENÉTICO DE TRIGO 653 $aRENDIMIENTO 653 $aTRITICUM AESTIVUM 700 1 $aQUINCKE, M. 700 1 $aGERMAN, S.
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