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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
31/03/2021 |
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Actualizado : |
31/03/2021 |
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Tipo de producción científica : |
Trabajos en Congresos/Conferencias |
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Autor : |
FORNERIS, N. S.; LEGARRA, A.; VITEZICA, Z. G.; TSURUTA, S.; AGUILAR, I.; CANTET, R.J.C.; MISZTAL, I. |
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Afiliación : |
NATALIA S. FORNERIS, Department of Animal Science, University of Buenos Aires, Argentina; ANDRÉS LEGARRA, INRA, Castanet-Tolosan, France; ZULMA G VITEZICA, INRA, Castanet-Tolosan, France; SHOGO TSURUTA, University of Georgia, Athens, GA, USA; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODOLFO J.C. CANTET, Department of Animal Science, University of Buenos Aires, Argentina; # CONICET, Argentina.; IGNACY MISZTAL, University of Georgia, Athens, GA, USA. |
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Título : |
Quality control of genotypes using heritability estimates of gene content. |
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Complemento del título : |
Volume Genetic Improvement Programs: Selection using molecular information (Posters), 471. |
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Fecha de publicación : |
2014 |
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Fuente / Imprenta : |
In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 10., Vancouver, BC, Canada, August 17-22, 2014. p.471. |
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Idioma : |
Inglés |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Quality control filtering of single nucleotide polymorphisms (SNP) is a key step when analyzing genomic data. Here, we present a practical method to identify poorly genotyped SNPs by detecting those for which gene content deviates from the pedigree-based expectation. This can be achieved by estimating the heritability of gene content at each marker, defined as the number of copies of a particular reference allele in a genotype of an animal (0, 1 or 2). The method uses Restricted Maximum Likelihood (REML) to estimate heritability of gene content at each SNP and also builds a likelihood ratio test statistic to test for zero error variance in genotyping. The proposed method is illustrated with a real dataset with genotypes from Illumina PorcineSNP60 chip. |
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Palabras claves : |
Gene Content; Heritability; Likelihood Ratio; Quality Control. |
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Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/15444/1/Forneris-et-al.-2014.-WCGALP.pdf
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Marc : |
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520 $aABSTRACT. Quality control filtering of single nucleotide polymorphisms (SNP) is a key step when analyzing genomic data. Here, we present a practical method to identify poorly genotyped SNPs by detecting those for which gene content deviates from the pedigree-based expectation. This can be achieved by estimating the heritability of gene content at each marker, defined as the number of copies of a particular reference allele in a genotype of an animal (0, 1 or 2). The method uses Restricted Maximum Likelihood (REML) to estimate heritability of gene content at each SNP and also builds a likelihood ratio test statistic to test for zero error variance in genotyping. The proposed method is illustrated with a real dataset with genotypes from Illumina PorcineSNP60 chip.
653 $aGene Content
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700 1 $aMISZTAL, I.
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Esconder MarcPresentar Marc Completo |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Biblioteca
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Identificación
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Origen
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Tacuarembó. Por información adicional contacte bibliotb@tb.inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Tacuarembó. |
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Fecha actual : |
21/02/2014 |
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Actualizado : |
26/09/2018 |
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Tipo de producción científica : |
Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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Autor : |
MONTOSSI, F.; SAN JULIAN, R.; BRITO, G.; LUZARDO, S.; DE BARBIERI, I.; SILVEIRA, C. |
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Afiliación : |
FABIO MARCELO MONTOSSI PORCHILE, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ROBERTO SAN JULIAN SANCHEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; GUSTAVO WALTER BRITO DIAZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SANTIAGO FELIPE LUZARDO VILLAR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; LUIS IGNACIO DE BARBIERI ETCHEBERRY, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CAROLINA INES SILVEIRA ROJAS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Producción de carne ovina de calidad en Uruguay. |
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Fecha de publicación : |
2008 |
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Fuente / Imprenta : |
ln: Sañudo Astiz, C.; González, C. Aspectos estratégicos para obtener carne ovina de calidad en el Cono Sur americano. Buenos Aires (Argentina): Agencia Española de Cooperación Internacional (AECI) Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Facultad de Ciencias Veterinarias; Programa Ovino de la Provincia de Buenos Aires, 2008. |
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Páginas : |
p. 60-78 |
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ISBN : |
978-950-658-206-7 |
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Idioma : |
Español |
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Palabras claves : |
ACEPTABILIDAD DE LOS CONSUMIDORES; TERNEZA DE LA CARNE. |
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Thesagro : |
CADENA CARNICA; CALIDAD; CANAL ANIMAL; CARNE; COLOR; OVINOS; TERNURA; URUGUAY. |
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Asunto categoría : |
L01 Ganadería |
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Marc : |
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773 $tln: Sañudo Astiz, C.; González, C. Aspectos estratégicos para obtener carne ovina de calidad en el Cono Sur americano. Buenos Aires (Argentina): Agencia Española de Cooperación Internacional (AECI) Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Facultad de Ciencias Veterinarias; Programa Ovino de la Provincia de Buenos Aires, 2008.
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Registro original : |
INIA Tacuarembó (TBO) |
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Clasificación
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