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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
28/07/2023 |
Actualizado : |
28/07/2023 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
RODRÍGUEZ, J.D.; PERIPOLLI, E.; LONDOÑO-GIL, M.; ESPIGOLAN, R.; LÔBO, R. B.; LÓPEZ-CORREA, R.; AGUILAR, I.; BALDI, F. |
Afiliación : |
JUAN DIEGO RODRÍGUEZ, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.; ELISA PERIPOLLI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; MARISOL LONDOÑO-GIL, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; RAFAEL ESPIGOLAN, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Departamento de Medicina Veterinária, Universidade de São Paulo (Usp), Pirassununga, 13535-900, Brazil.; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, Ribeirão Preto, Brazil; RODRIGO LÓPEZ-CORREA, Facultad de Veterinaria, Departamento de Genética y Mejoramiento Animal, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BALDI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil. |
Título : |
Effect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population. |
Complemento del título : |
Research paper. |
Fecha de publicación : |
2023 |
Fuente / Imprenta : |
Animal Production Science. 2023, volume 63, issue 9, p. 844-852. https://doi.org/10.1071/AN21581 |
ISSN : |
1836-0939; eISSN: 1836-5787. |
DOI : |
10.1071/AN21581 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023, Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez,
Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br -- Handling Editor: Kim Bunter. -- |
Contenido : |
Context: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes.
Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population.
© 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing |
Palabras claves : |
Bias; Bovine; Customised SNP arrays; Genomic selection; Imputation accuracy; Inflation; MAF; Simulation. |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
Marc : |
LEADER 02068naa a2200337 a 4500 001 1064277 005 2023-07-28 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1836-0939; eISSN: 1836-5787. 024 7 $a10.1071/AN21581$2DOI 100 1 $aRODRÍGUEZ, J.D. 245 $aEffect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population.$h[electronic resource] 260 $c2023 500 $aArticle history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023, Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br -- Handling Editor: Kim Bunter. -- 520 $aContext: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes. Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population. © 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing 653 $aBias 653 $aBovine 653 $aCustomised SNP arrays 653 $aGenomic selection 653 $aImputation accuracy 653 $aInflation 653 $aMAF 653 $aSimulation 700 1 $aPERIPOLLI, E. 700 1 $aLONDOÑO-GIL, M. 700 1 $aESPIGOLAN, R. 700 1 $aLÔBO, R. B. 700 1 $aLÓPEZ-CORREA, R. 700 1 $aAGUILAR, I. 700 1 $aBALDI, F. 773 $tAnimal Production Science. 2023, volume 63, issue 9, p. 844-852. https://doi.org/10.1071/AN21581
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
Fecha actual : |
26/08/2015 |
Actualizado : |
31/05/2018 |
Tipo de producción científica : |
Documentos |
Autor : |
RICCETTO, S.; MACEDO, I.; GASO, D.; SALDAIN, N.E.; TERRA, J.A. |
Afiliación : |
SARA MAGDALENA RICCETTO AGUIRREZABALA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; IGNACIO MACEDO YAPOR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DEBORAH VIVIANA GASO MELGAR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; NÉSTOR ELIO SALDAIN CROCCE, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JOSÉ ALFREDO TERRA FERNÁNDEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
Título : |
Potencial productivo del cultivo de soja sin limitantes de agua. |
Fecha de publicación : |
2015 |
Fuente / Imprenta : |
ln: [JORNADA ANUAL] ARROZ-SOJA, 2015, Treinta y Tres, UY. Resultados experimentales 2014-2015. Treinta y Tres: INIA, 2015. |
Páginas : |
Cap. 6, p. 7-9. |
Serie : |
(INIA Serie Actividades de Difusión; 748) |
ISSN : |
1688-9258 |
Idioma : |
Español |
Thesagro : |
RENDIMIENTO; RIEGO; SISTEMAS AGRICOLAS; SOJA. |
Asunto categoría : |
-- |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/7918/1/ad-748-cap-6-p.7-9.pdf
|
Marc : |
LEADER 00725naa a2200241 a 4500 001 1053303 005 2018-05-31 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1688-9258 100 1 $aRICCETTO, S. 245 $aPotencial productivo del cultivo de soja sin limitantes de agua. 260 $c2015 300 $aCap. 6, p. 7-9. 490 $a(INIA Serie Actividades de Difusión; 748) 650 $aRENDIMIENTO 650 $aRIEGO 650 $aSISTEMAS AGRICOLAS 650 $aSOJA 700 1 $aMACEDO, I. 700 1 $aGASO, D. 700 1 $aSALDAIN, N.E. 700 1 $aTERRA, J.A. 773 $tln: [JORNADA ANUAL] ARROZ-SOJA, 2015, Treinta y Tres, UY. Resultados experimentales 2014-2015. Treinta y Tres: INIA, 2015.
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