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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
26/11/2015 |
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Actualizado : |
25/11/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
MASUDA, Y.; AGUILAR, I.; TSURUTA, S.; MISZTAL, I. |
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Afiliación : |
Y. MASUDA, Universidad de Georgia (UG); Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine (Japón); IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SHOGO TSURUTA, Universidad de Georgia (UG); IGNACY MISZTAL, Universidad de Georgia (UG). |
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Título : |
Technical note: Acceleration of sparse operations for average-information REML analyses with supernodal methods and sparse-storage refinements. |
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Fecha de publicación : |
2015 |
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Fuente / Imprenta : |
Journal of Animal Science, 2015, v. 93, p. 4670 - 4674. Published October 9, 2015 |
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DOI : |
10.2527/jas.2015-9395 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received June 8, 2015.; Accepted August 7, 2015.
1. We acknowledge the work by François Guillaume in programming a hash function. We greatly appreciate the work of the two anonymous reviewers.
2. The AIREMLF90 program with a sparse package YAMS, along with a manual, is available at http://nce.ads.uga.edu. The YAMS package is available on request for academic or noncommercial purposes by contacting the corresponding author. |
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Contenido : |
ABSTRACT.
The objective of this study was to remove bottlenecks generally found in a computer program for average-information REML. The refinements included improvements to setting-up mixed-model equations on a hash table with a faster hash function as sparse matrix storage, changing sparse structures in calculation of traces, and replacing a sparse matrix
package using traditional methods (FSPAK) with a new package using supernodal methods (YAMS); the latter package quickly processed sparse matrices containing large, dense blocks. Comparisons included 23 models with data sets from broiler, swine, beef, and dairy cattle. Models included single-trait, multiple-trait, maternal, and random regression models with phenotypic data; selected models used genomic information in a singlestep approach. Setting-up mixed model equations was completed without abnormal termination in all analyses. Calculations in traces were accelerated with a hash format, especially for models with a genomic relationship matrix, and the maximum speed was 67 times faster. Computations with YAMS were, on average, more than 10 times faster than with FSPAK and had greater advantages for large data and more complicated models including multiple traits, random regressions, and genomic effects. These refinements can be applied to general average-information REML programs.
© 2015 American Society of Animal Science. All rights reserved. |
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Palabras claves : |
AVERAGE-INFORMATION REML; HASH FORMAT; SPARSE MATRIX; SPARSE PACKAGES. |
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Thesagro : |
MODELOS DE SIMULACIÓN. |
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Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
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Marc : |
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500 $aArticle history: Received June 8, 2015.; Accepted August 7, 2015. 1. We acknowledge the work by François Guillaume in programming a hash function. We greatly appreciate the work of the two anonymous reviewers. 2. The AIREMLF90 program with a sparse package YAMS, along with a manual, is available at http://nce.ads.uga.edu. The YAMS package is available on request for academic or noncommercial purposes by contacting the corresponding author.
520 $aABSTRACT. The objective of this study was to remove bottlenecks generally found in a computer program for average-information REML. The refinements included improvements to setting-up mixed-model equations on a hash table with a faster hash function as sparse matrix storage, changing sparse structures in calculation of traces, and replacing a sparse matrix package using traditional methods (FSPAK) with a new package using supernodal methods (YAMS); the latter package quickly processed sparse matrices containing large, dense blocks. Comparisons included 23 models with data sets from broiler, swine, beef, and dairy cattle. Models included single-trait, multiple-trait, maternal, and random regression models with phenotypic data; selected models used genomic information in a singlestep approach. Setting-up mixed model equations was completed without abnormal termination in all analyses. Calculations in traces were accelerated with a hash format, especially for models with a genomic relationship matrix, and the maximum speed was 67 times faster. Computations with YAMS were, on average, more than 10 times faster than with FSPAK and had greater advantages for large data and more complicated models including multiple traits, random regressions, and genomic effects. These refinements can be applied to general average-information REML programs. © 2015 American Society of Animal Science. All rights reserved.
650 $aMODELOS DE SIMULACIÓN
653 $aAVERAGE-INFORMATION REML
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Esconder MarcPresentar Marc Completo |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Biblioteca
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
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Fecha actual : |
19/11/2015 |
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Actualizado : |
08/03/2018 |
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Tipo de producción científica : |
Actividades de Difusión |
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Autor : |
JORNADA ANUAL ARROZ-SOJA, 1983, CIAAB-EEE, TREINTA Y TRES, UY.; CHEBATAROFF, N.; DEAMBROSI, E.; BLANCO, P.H.; ÁVILA, S.; MÉNDEZ, R.; YANG, C.W.; WANG, W.J.; LAVECCHIA, A. |
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Afiliación : |
NICOLÁS CHEBATAROFF; ENRIQUE GERMAN DEAMBROSI CHURRUT, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PEDRO HORACIO BLANCO BARRAL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARIFLOR STELLA ÁVILA SILVA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RAMÓN FELIPE MÉNDEZ LARROSA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANDRES PASCUAL LAVECCHIA GONZALEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Arroz-soja: Resultados de la experimentación regional en cultivos 1982-83. |
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Fecha de publicación : |
1983 |
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Fuente / Imprenta : |
Treinta y Tres (Uruguay): CIAAB; EEE, 1983 |
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Páginas : |
104 p. |
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Idioma : |
Español |
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Notas : |
Actividad realizada en Agosto de 1983. |
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Contenido : |
ARROZ
Mejoramiento
Épocas de siembra. Ensayos varietales. Ensayos regionales varietales. Respuesta varietal a nitrògeno. Convenio de Cooperación Técnico Agrícola con la República de China. Situación actual y perspectivas del mejoramiento genético de arroz en Uruguay.
Manejo
Ensayos regionales de fertilización. Manejo de nitrógeno. Discusión general de fertilización. Tesis de graduación. Ensayos especiales. Control de maleza.
Fitopatologìa
Camas de infección. Propagaciòn y daño provocado por enfermedades del tallo. Evaluación de fungicidas a campo. Evaluación de fungicidas en laboratorio.
SOJA
Ensayos varietales. Fertilización.
EVALUACIÒN DE DOS SISTEMAS INTENSIVOS DE PRODUCCIÓN EN SUELOS ARROCEROS.
DATOS CLIMÁTICOS |
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Palabras claves : |
SISTEMA ARROZ-SOJA; SISTEMAS INTENSIVOS. |
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Thesagro : |
ARROZ; SOJA. |
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Asunto categoría : |
F01 Cultivo |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5254/1/Arroz-Soja1982-1983.pdf
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Marc : |
LEADER 01562nam a2200277 a 4500
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005 2018-03-08
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500 $aActividad realizada en Agosto de 1983.
520 $aARROZ Mejoramiento Épocas de siembra. Ensayos varietales. Ensayos regionales varietales. Respuesta varietal a nitrògeno. Convenio de Cooperación Técnico Agrícola con la República de China. Situación actual y perspectivas del mejoramiento genético de arroz en Uruguay. Manejo Ensayos regionales de fertilización. Manejo de nitrógeno. Discusión general de fertilización. Tesis de graduación. Ensayos especiales. Control de maleza. Fitopatologìa Camas de infección. Propagaciòn y daño provocado por enfermedades del tallo. Evaluación de fungicidas a campo. Evaluación de fungicidas en laboratorio. SOJA Ensayos varietales. Fertilización. EVALUACIÒN DE DOS SISTEMAS INTENSIVOS DE PRODUCCIÓN EN SUELOS ARROCEROS. DATOS CLIMÁTICOS
650 $aARROZ
650 $aSOJA
653 $aSISTEMA ARROZ-SOJA
653 $aSISTEMAS INTENSIVOS
700 1 $aCHEBATAROFF, N.
700 1 $aDEAMBROSI, E.
700 1 $aBLANCO, P.H.
700 1 $aÁVILA, S.
700 1 $aMÉNDEZ, R.
700 1 $aYANG, C.W.
700 1 $aWANG, W.J.
700 1 $aLAVECCHIA, A.
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Registro original : |
INIA Treinta y Tres (TT) |
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