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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
02/02/2022 |
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Actualizado : |
02/02/2022 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
TORRES, D.; DELGADO-CERRONE, L.; LUNA, L.; RESQUÍN, F.; AGUILAR, A.V.; SEBENN, A.M. |
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Afiliación : |
DIEGO GABRIEL TORRES DINI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; LEONARDO DELGADO-CERRONE, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (IIBCE), Av. Italia 3318, 11600 Montevideo, Uruguay.; LORENA LUNA, Centro Universitario de Tacuarembó (CUT), Ruta 5 Km 386, CEP 45000, Tacuarembó, TB, Uruguay; JOSE FERNANDO RESQUIN PEREZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANANDA VIRGINIA AGUIAR, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA), Centro Nacional de Pesquisa de Florestas, Estrada da Ribeira, Km 111 - Bairro Guaraituba, 83411-000, Colombo, PR, Brazil.; ALEXANDRE MAGNO SEBBENN, Instituto Florestal de São Paulo, CP 1322, São Paulo, SP, 01059-970, Brazil. |
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Título : |
The traceability of Eucalyptus clones using molecular markers. |
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Fecha de publicación : |
2021 |
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Fuente / Imprenta : |
Silvae Genetica, 2021, 70(1) 217-225. OPEN ACCESS. https://doi.org/10.2478/sg-2021-0019 |
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DOI : |
10.2478/sg-2021-0019 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Published Online 25 Dec 2021.
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 3.0 License.
Corresponding author: Diego Torres-Dini, E-mail: diego.torres.dini@gmail.com |
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Contenido : |
ABSTRACT.- The improvement of Eucalyptus clones plays a crucial role in modern silviculture. This study used a set of 17 microsatellite loci to analyze the genetic diversity and structure of 107 elite clones (80 E. grandis and 27 E. globulus). All clones were cultivated in Uruguay and were sourced from three different providers. Using the fingerprinting technique, an exclusive molecular profile was assigned for each clone, and the genotyping reaction showed differences between the two species. The cumulative probability of identifying two random individuals that share the same genotype (???? ) with all 17 loci, was estimated as low for E. grandis (1.18×10-15) and E. globulus (4.03×10-14). The combined PIsibs was (1.05×10-5) and (2.17×10-5) for E. grandis and E. globulus, respectively. A total of 180 alleles were detected for E. grandis and 100 for E. globulus. We found a high mean number of alleles per locus (10 for E. grandis and 6 for E. globulus), and the results for mean polymorphic information content ( PIC ) were (0.648) and (0.548), respectively. The observed heterozygosity ( Ho ) ranged from 0.216 to 0.838 (mean = 0.509) for E. grandis and 0 to 1 (mean = 0.566) for E. globulus. Two core sets of seven EST-SSR loci were identified for each species. These markers revealed unambiguous fragment amplification, providing a minimum number of SSRs for effective clonal identification. The genetic structure analysis suggests that the germplasm of the E. grandis population is structured in four clusters, while the E. globulus population consists of two clusters.
© 2020 Diego Torres-Dini et al., published by Sciendo MenosABSTRACT.- The improvement of Eucalyptus clones plays a crucial role in modern silviculture. This study used a set of 17 microsatellite loci to analyze the genetic diversity and structure of 107 elite clones (80 E. grandis and 27 E. globulus). All clones were cultivated in Uruguay and were sourced from three different providers. Using the fingerprinting technique, an exclusive molecular profile was assigned for each clone, and the genotyping reaction showed differences between the two species. The cumulative probability of identifying two random individuals that share the same genotype (???? ) with all 17 loci, was estimated as low for E. grandis (1.18×10-15) and E. globulus (4.03×10-14). The combined PIsibs was (1.05×10-5) and (2.17×10-5) for E. grandis and E. globulus, respectively. A total of 180 alleles were detected for E. grandis and 100 for E. globulus. We found a high mean number of alleles per locus (10 for E. grandis and 6 for E. globulus), and the results for mean polymorphic information content ( PIC ) were (0.648) and (0.548), respectively. The observed heterozygosity ( Ho ) ranged from 0.216 to 0.838 (mean = 0.509) for E. grandis and 0 to 1 (mean = 0.566) for E. globulus. Two core sets of seven EST-SSR loci were identified for each species. These markers revealed unambiguous fragment amplification, providing a minimum number of SSRs for effective clonal identification. The genetic structure analysis suggests that the germplasm of the E. grandis population is st... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
Clone; Clone certification; Genotyping; Identity; Multiplex; Nurseries; Traceability. |
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Asunto categoría : |
K01 Ciencias forestales - Aspectos generales |
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URL : |
https://sciendo.com/pdf/10.2478/sg-2021-0019
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Marc : |
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520 $aABSTRACT.- The improvement of Eucalyptus clones plays a crucial role in modern silviculture. This study used a set of 17 microsatellite loci to analyze the genetic diversity and structure of 107 elite clones (80 E. grandis and 27 E. globulus). All clones were cultivated in Uruguay and were sourced from three different providers. Using the fingerprinting technique, an exclusive molecular profile was assigned for each clone, and the genotyping reaction showed differences between the two species. The cumulative probability of identifying two random individuals that share the same genotype (???? ) with all 17 loci, was estimated as low for E. grandis (1.18×10-15) and E. globulus (4.03×10-14). The combined PIsibs was (1.05×10-5) and (2.17×10-5) for E. grandis and E. globulus, respectively. A total of 180 alleles were detected for E. grandis and 100 for E. globulus. We found a high mean number of alleles per locus (10 for E. grandis and 6 for E. globulus), and the results for mean polymorphic information content ( PIC ) were (0.648) and (0.548), respectively. The observed heterozygosity ( Ho ) ranged from 0.216 to 0.838 (mean = 0.509) for E. grandis and 0 to 1 (mean = 0.566) for E. globulus. Two core sets of seven EST-SSR loci were identified for each species. These markers revealed unambiguous fragment amplification, providing a minimum number of SSRs for effective clonal identification. The genetic structure analysis suggests that the germplasm of the E. grandis population is structured in four clusters, while the E. globulus population consists of two clusters. © 2020 Diego Torres-Dini et al., published by Sciendo
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INIA Las Brujas (LB) |
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| Registros recuperados : 72 | |
| 42. |  | CARRASCO-LETELIER, L.; BERETTA, A.; BASSAHÚN, D.; GARCÍA, L.; MUSSELLI, R.; TORRES, D.; TORRES, O. Survey of Uruguayan freshwater water quality for crop irrigation: abstract. Agrociencia Uruguay, v. 19, special issue "Inter-Regional CIGR Conference on Land and Water Challenges, 3., La Estanzuela, Colonia, UY. Tools for developing; "Dr. Mario García Petillo"", p. 73, 2015. En versión electrónica difiere la paginación: Agrociencia Uruguay, v. 19, special issue, p. 77, 2015.| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 46. | | BALMELLI, G.; RESQUIN, F.; SIMETO, S.; TORRES, D.; NUÑEZ, P.; RODRIGUEZ, F.; GONZALEZ, G. Variabilidad genética en susceptibilidad a Teratosphaeria pseudoeucalypti en eucaliptos colorados. In: JORNADA TÉCNICA DE PROTECCIÓN FORESTAL, 6., 2013, TACUAREMBÓ, UY; BALMELLI, G.; SIMETO, S.; MARTINEZ, G.; GOMEZ, D. (Ed.). Montevideo, UY: INIA, 2014. 85-91 (INIA Serie Técnica; 213)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 47. | | BALMELLI, G.; RESQUÍN, F.; SIMETO, S.; TORRES, D.; NUÑEZ, P.; RODRIGUEZ, F.; GONZALEZ, C. Variabilidad genética en susceptibilidad a Teratosphaeria pseudoeucalypti en eucaliptos colorados. [Presentación oral]. In: Jornada Técnica de Protección Forestal, 6., 14 y 15 de Noviembre, Tacuarembó. Tacuarembó: INIA, 2013.| Tipo: Presentaciones Orales |
| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 48. | | SIMETO, S.; TORRES, D.; BALMELLI, G.; MARTÍNEZ, G.; PEREZ, C.; ALTIER, N.; BETTUCCI, L. Variabilidad genética de la roya del eucalipto. In: BALMELLI, G.; SIMETO, S.; MARTÍNEZ, G.; GÓMEZ, D. (Eds.). V Jornada técnica de protección forestal. Avances de investigación en plagas y enfermedades forestales Montevideo (UY): INIA, 2013. p. 45-54 (INIA Serie Técnica; 209)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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| 49. | | CARRASCO-LETELIER, L.; BERETTA, A.; BASSAHUN, D.; GARCIA, L.; MUSSELLI, R.; OTEN, R.; TORRES, D.; TORRES, O.; TELLECHEA, G. Aptitud de la calidad del agua para uso agropecuario: riego y preparación de pesticidas. Revista INIA Uruguay, 2015, n. 41, p. 45-48 (Revista INIA; 41)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Tacuarembó. |
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| 50. | | SIMETO, S.; LUPO, S.; BETTUCCI, L.; PÉREZ, C.; GÓMEZ, D.; TORRES, D.; MARTÍNEZ, G.; ALTIER, N.; RIVAS, F. Desarrollo de bioinsecticidas (hongos entomapatógenos) para el control de la chinche del eucalipto Thaumastocoris peregrinus. ln: INIA TACUAREMBÓ. PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN EN PRODUCCIÓN FORESTAL. V Jornada de Protección Forestal, 14 y 15 de noviembre, Tacuarembó. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2012. p. 8 (INIA Serie Actividades de Difusión; 703)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 51. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; ALTIER, N.; MAC GREGOR, J.; PEVERELLI, A.; DIEZ, J. Control genético de la resistencia y del escape a Teratosphaeria nubilosaen Eucalyptus globulus en Uruguay. [Presentación oral]. In: Congreso IUFRO, Pucón, Chile, 22-23 de Noviembre. Eucaliptos genéticamente mejorados para aumentar la competitividad del sector forestal en América Latina. Pucón: IUFRO, 2012.| Tipo: Presentaciones Orales |
| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 52. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; ALTIER, N.; NUÑEZ, P.; RODRIGUEZ, F.; GONZALEZ, C.; PÉREZ, G.; DIEZ, J. Efecto del daño de Teratosphaeria nubilosa sobre el crecimiento de Eucalyptus globulus y Eucalyptus maidenii. [Presentación oral]. In: Jornada Técnica de Protección Forestal, 6., 14 y 15 de Noviembre, Tacuarembó. Tacuarembó: INIA, 2013.| Tipo: Presentaciones Orales |
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| 53. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; HIRIGOYEN, A.; CASTILLO, A.; ALTIER, N.; PÉREZ, G.; DIEZ, J.J. Impact of Teratosphaeria nubilosa over tree growth and survival of Eucalyptus globulus and Eucalyptus maidenii in Uruguay. New Forests, 2016, v. 47, p. 829-843. Article history: Received: 14 April 2016; Accepted: 15 July 2016; Published online: 18 July 2016.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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| 54. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; ALTIER, N.; PÉREZ, G.; MAC GREGOR, J.; PEVERELLI, A.; DIEZ, J.J. Mejoramiento genético en eucalyptus globulus y eucalyptus maidenii por resistencia a Teratosphaeria nubilosa. In: BALMELLI, G.; SIMETO, S.; MARTÍNEZ, G.; GÓMEZ, D. (Eds.). V Jornada técnica de protección forestal. Avances de investigación en plagas y enfermedades forestales Montevideo (UY): INIA, 2013. p. 55-65 (INIA Serie Técnica; 209)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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| 55. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; PÉREZ, G.; MAC GREGOR, J.; PEVERELLI, A.; ALTIER, N.; DIEZ, J. Mejoramiento genético en Eucalyptus globulus y Eucalyptus maidenii por resistencia a Teratosphaeria nubilosa. ln: INIA TACUAREMBÓ. PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN EN PRODUCCIÓN FORESTAL. V Jornada de Protección Forestal, 14 y 15 de noviembre, Tacuarembó. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2012. p. 14 (INIA Serie Actividades de Difusión; 703)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 56. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; PÉREZ, G.; MAC GREGOR, J.; PEVERELLI, A.; ALTIER, N.; DIEZ, J. Mejoramiento Genético en Eucalyptus globulus y Eucalyptus maidenii por resistencia a Teratosphaeria nubilosa. [Presentación oral]. In: Jornada de Protección Forestal, 5., INIA Tacuarembó, 14 y 15 de Noviembre. Tacuarembó: INIA, 2012.| Tipo: Presentaciones Orales |
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| 57. | | BALMELLI, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; CASTILLO, A.; ALTIER, N.; NUÑEZ, P.; RODRIGUEZ, F.; GONZALEZ, W.; PÉREZ, G.; DIEZ, J. Impacto productivo de Teratosphaeria nubilosa en Eucalyptus globulus y Eucalyptus maidenii. [Presentación oral]. In: VII Jornada Técnica de Protección Forestal, 7., 6 y 7 de Noviembre, Tacuarembó. Tacuarembó: INIA, 2014.| Tipo: Presentaciones Orales |
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| 58. | | PÉREZ, C.A.; MARTÍNEZ, G.; SIMETO, S.; TORRES, D.; PALLADINO, C.; LANGONE, F.; BENTANCUR, O.; BALMELLI, G. Prospección sanitaria en plantaciones jóvenes de eucalipto primavera 2008-otoño 2012 In: BALMELLI, G.; SIMETO, S.; MARTÍNEZ, G.; GÓMEZ, D. (Eds.). V Jornada técnica de protección forestal. Avances de investigación en plagas y enfermedades forestales Montevideo (UY): INIA, 2013. p. 23-28 (INIA Serie Técnica; 209)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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| 60. | | BOVE, R.; LÓPEZ, F.; PERERA, C.; CARRACELAS, B.; TORRES, D.; DE SOUZA, G.; AZAMBUJA, C.; BERMÚDEZ, J.; ALZUGARAY, F.; MEDEROS, A. Diagnóstico Campylobacter fetus venerealis por PCR, en un aborto bovino espontáneo // Diagnosis of Campylobacter fetus venerealis in aborted bovine fetus. Veterinaria (Montevideo), 2013, v. 49, no. 192, p. 20-28. History article: Recibido: 25/02/2013; Aprobado: 01/04/2013.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Nacionales | Circulación / Nivel : Nacional - -- |
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