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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Treinta y Tres. Por información adicional contacte bibliott@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
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Fecha : |
13/04/2022 |
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Actualizado : |
17/05/2022 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
PEREIRA MORA, L.; TERRA, J.A.; FERNÁNDEZ SCAVINO, A. |
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Afiliación : |
LUCIANA PEREIRA MORA, Area Microbiología, Departamento de Biociencias, Facultad de Química, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay.; JOSÉ ALFREDO TERRA FERNÁNDEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA FERNÁNDEZ SCAVINO, Area Microbiología, Departamento de Biociencias, Facultad de Química, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay. |
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Título : |
Methanogenic community linked to organic acids fermentation from root exudates are affected by rice intensification in rotational soil systems. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
Applied Soil Ecology, 2022, volume 176, artículo 104498. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2022.104498 |
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Páginas : |
9 p. |
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DOI : |
10.1016/j.apsoil.2022.104498 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
History Article: Received 30 December 2021; Received in revised form 1 April 2022; Accepted 4 April 2022; Available online 13 April 2022.
Corresponding author: afernand@fq.edu.uy (A. Fernandez-Scavino). |
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Contenido : |
Rice paddy soils are an important biogenic source of methane, a relevant greenhouse gas. Rice rotation with upland crops and pastures affects hydrolytic and fermentative bacteria and methanogenic archaea by sequential exposition to oxic and anoxic conditions. There are several ways to reduce methane emissions from rice paddy soils. Here we examine the effect of intensification in rice rotations with upland crops upon the microbial community structure and methanogenesis when dicarboxylic acids exudated by rice root were amended in microcosms assays. Soils under rotations rice-pasture, rice-soybean and continuous rice, with the last two more intensive systems recently installed in the field experiment, were sampled. Amplicon sequencing of 16S rRNA gene analysis showed that the rotation system was a main driver of the microbial community structure, explaining 33%, 38% and 55% of the differences in the structure of Bacteria, Archaea and methanogens,
respectively. The density of mcrA gene copies was significantly higher in continuous rice soil than in other soils, and the relative abundance of methanogenic archaea was 33% for rice monoculture, whereas represented 15% and 14% for the rice-pasture and rice-soybean soils, respectively. The incubation of soils with tartrate and
succinate confirmed functional differences among soils since rice monoculture showed similar or higher methane production and significantly less acetate and propionate accumulation than other soils. The T-RFLP analysis of mcrA gene in soils and incubated soils revealed that Rice Cluster I increased after incubation in all rotational soils, whereas Methanosarcinaceae and Methanobacteriaceae remained relevant after incubation. Furthermore, a more stable community of methanogenic archaea was established in soil under continuous rice, since T-RF profiles of soils and incubated soils with dicarboxylic acids grouped together with 62% similarity, while communities from other rotational soils experimented a great shift after incubation with these substrates. Altogether, these results showed that the conversion of rice-pasture rotational fields to a more intensive rice crop production strongly impacts the methanogenic community structure and their potential for methane emission. MenosRice paddy soils are an important biogenic source of methane, a relevant greenhouse gas. Rice rotation with upland crops and pastures affects hydrolytic and fermentative bacteria and methanogenic archaea by sequential exposition to oxic and anoxic conditions. There are several ways to reduce methane emissions from rice paddy soils. Here we examine the effect of intensification in rice rotations with upland crops upon the microbial community structure and methanogenesis when dicarboxylic acids exudated by rice root were amended in microcosms assays. Soils under rotations rice-pasture, rice-soybean and continuous rice, with the last two more intensive systems recently installed in the field experiment, were sampled. Amplicon sequencing of 16S rRNA gene analysis showed that the rotation system was a main driver of the microbial community structure, explaining 33%, 38% and 55% of the differences in the structure of Bacteria, Archaea and methanogens,
respectively. The density of mcrA gene copies was significantly higher in continuous rice soil than in other soils, and the relative abundance of methanogenic archaea was 33% for rice monoculture, whereas represented 15% and 14% for the rice-pasture and rice-soybean soils, respectively. The incubation of soils with tartrate and
succinate confirmed functional differences among soils since rice monoculture showed similar or higher methane production and significantly less acetate and propionate accumulation than other soils. The T-RFLP... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
CROP ROTATION; CROP ROTATION SYSTEMS; METHANOGENS; RICE INTENSIFICATION; ROOT EXUDATION. |
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Asunto categoría : |
F01 Cultivo |
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Marc : |
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520 $aRice paddy soils are an important biogenic source of methane, a relevant greenhouse gas. Rice rotation with upland crops and pastures affects hydrolytic and fermentative bacteria and methanogenic archaea by sequential exposition to oxic and anoxic conditions. There are several ways to reduce methane emissions from rice paddy soils. Here we examine the effect of intensification in rice rotations with upland crops upon the microbial community structure and methanogenesis when dicarboxylic acids exudated by rice root were amended in microcosms assays. Soils under rotations rice-pasture, rice-soybean and continuous rice, with the last two more intensive systems recently installed in the field experiment, were sampled. Amplicon sequencing of 16S rRNA gene analysis showed that the rotation system was a main driver of the microbial community structure, explaining 33%, 38% and 55% of the differences in the structure of Bacteria, Archaea and methanogens, respectively. The density of mcrA gene copies was significantly higher in continuous rice soil than in other soils, and the relative abundance of methanogenic archaea was 33% for rice monoculture, whereas represented 15% and 14% for the rice-pasture and rice-soybean soils, respectively. The incubation of soils with tartrate and succinate confirmed functional differences among soils since rice monoculture showed similar or higher methane production and significantly less acetate and propionate accumulation than other soils. The T-RFLP analysis of mcrA gene in soils and incubated soils revealed that Rice Cluster I increased after incubation in all rotational soils, whereas Methanosarcinaceae and Methanobacteriaceae remained relevant after incubation. Furthermore, a more stable community of methanogenic archaea was established in soil under continuous rice, since T-RF profiles of soils and incubated soils with dicarboxylic acids grouped together with 62% similarity, while communities from other rotational soils experimented a great shift after incubation with these substrates. Altogether, these results showed that the conversion of rice-pasture rotational fields to a more intensive rice crop production strongly impacts the methanogenic community structure and their potential for methane emission.
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Registro original : |
INIA Treinta y Tres (TT) |
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Clasificación
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Registro
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
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Fecha actual : |
02/01/2019 |
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Actualizado : |
05/07/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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Autor : |
SILVA, P.; LADO, B.; BRANDARIZ, S.; BERRO, I.; GUTIÉRREZ, L.; PEREYRA, S.; GERMAN, S.; VON ZITZEWITZ, J.; QUINCKE, M. |
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Afiliación : |
MARIA PAULA SILVA VILLELLA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; BETTINA LADO LINDNER, Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; LUCÍA GUTIÉRREZ, Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; SILVIA ANTONIA PEREYRA CORREA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA ELISA GERMAN FAEDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JARISLAV RAMON VON ZITZEWITZ VON SALVIATI, SECOBRA Saatzucht GmbH, Feldkirchen 3, 85368 Moosburg, Alemania.; MARTIN CONRADO QUINCKE WALDEN, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Herramientas utilizadas y avances en mejoramiento molecular en el programa de mejoramiento genético de trigo de Inia Uruguay. |
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Fecha de publicación : |
2018 |
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Fuente / Imprenta : |
In: German, S.; Quincke, M.; Vázquez, D.; Castro, M.; Pereyra, S.; Silva, P.; García, A. (Eds.). Seminario Internacional "1914-2014: Un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela". Montevideo (UY): INIA, 2018. |
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Páginas : |
p. 277-285. |
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Serie : |
(INIA Serie Técnica; 241). |
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ISSN : |
1688-9266 |
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DOI : |
http://doi.org/10.35676/INIA/ST.241 |
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Idioma : |
Español |
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Contenido : |
RESUMEN
El Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) de INIA tiene como objetivo principal liberar cultivares adaptados a las condiciones locales, dirigiendo los esfuerzos de mejoramiento hacia características de importancia agronómica como rendimiento, calidad de grano, estreses bióticos y abióticos. La selección fenotípica (SF) por estas características ha sido responsable de los avances en mejoramiento durante los últimos 100 años del programa. Las limitantes de la SF como herramienta única y el gran avance en el área molecular han conducido a la aplicación de diversas herramientas moleculares como ser la selección asistida por marcadores (SAM) y la selección genómica (SG), entre otras. En los últimos años se han incorporado este tipo de herramientas de mejoramiento al PMGT con el fin de incrementar la eficiencia de selección y acortar los tiempos que requiere la liberación de nuevas variedades. En particular, se ha abocado a la búsqueda y utilización de marcadores moleculares asociados a resistencia a enfermedades como roya de la hoja, roya de tallo y fusariosis de la espiga. Por otro lado, el avance en las técnicas de secuenciación masiva ha permitido la incorporación de técnicas como genotipado por secuenciación con el fin de seleccionar por caracteres cuantitativos como rendimiento, calidad de grano y resistencia a enfermedades. A futuro, los objetivos se enfocarán en la estandarización del uso de marcadores moleculares (i.e. chips) y en combinar SAM y SG con el fin de potenciar la selección dentro del PMGT. MenosRESUMEN
El Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) de INIA tiene como objetivo principal liberar cultivares adaptados a las condiciones locales, dirigiendo los esfuerzos de mejoramiento hacia características de importancia agronómica como rendimiento, calidad de grano, estreses bióticos y abióticos. La selección fenotípica (SF) por estas características ha sido responsable de los avances en mejoramiento durante los últimos 100 años del programa. Las limitantes de la SF como herramienta única y el gran avance en el área molecular han conducido a la aplicación de diversas herramientas moleculares como ser la selección asistida por marcadores (SAM) y la selección genómica (SG), entre otras. En los últimos años se han incorporado este tipo de herramientas de mejoramiento al PMGT con el fin de incrementar la eficiencia de selección y acortar los tiempos que requiere la liberación de nuevas variedades. En particular, se ha abocado a la búsqueda y utilización de marcadores moleculares asociados a resistencia a enfermedades como roya de la hoja, roya de tallo y fusariosis de la espiga. Por otro lado, el avance en las técnicas de secuenciación masiva ha permitido la incorporación de técnicas como genotipado por secuenciación con el fin de seleccionar por caracteres cuantitativos como rendimiento, calidad de grano y resistencia a enfermedades. A futuro, los objetivos se enfocarán en la estandarización del uso de marcadores moleculares (i.e. chips) y en combinar SAM y SG con ... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
MAPERO ASOCIATIVO; PROGRAMA MEJORAMIENTO GENÉTICO DE TRIGO (PMGT); QTL; SELECCIÓN GENÓMICA. |
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Thesagro : |
MARCADORES MOLECULARES; TRIGO; TRITICUM AESTIVUM. |
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Asunto categoría : |
F01 Cultivo |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/12227/1/st-241-2018.p.277-285-Silva-et-al.pdf
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Marc : |
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520 $aRESUMEN El Programa de Mejoramiento Genético de Trigo (PMGT) de INIA tiene como objetivo principal liberar cultivares adaptados a las condiciones locales, dirigiendo los esfuerzos de mejoramiento hacia características de importancia agronómica como rendimiento, calidad de grano, estreses bióticos y abióticos. La selección fenotípica (SF) por estas características ha sido responsable de los avances en mejoramiento durante los últimos 100 años del programa. Las limitantes de la SF como herramienta única y el gran avance en el área molecular han conducido a la aplicación de diversas herramientas moleculares como ser la selección asistida por marcadores (SAM) y la selección genómica (SG), entre otras. En los últimos años se han incorporado este tipo de herramientas de mejoramiento al PMGT con el fin de incrementar la eficiencia de selección y acortar los tiempos que requiere la liberación de nuevas variedades. En particular, se ha abocado a la búsqueda y utilización de marcadores moleculares asociados a resistencia a enfermedades como roya de la hoja, roya de tallo y fusariosis de la espiga. Por otro lado, el avance en las técnicas de secuenciación masiva ha permitido la incorporación de técnicas como genotipado por secuenciación con el fin de seleccionar por caracteres cuantitativos como rendimiento, calidad de grano y resistencia a enfermedades. A futuro, los objetivos se enfocarán en la estandarización del uso de marcadores moleculares (i.e. chips) y en combinar SAM y SG con el fin de potenciar la selección dentro del PMGT.
650 $aMARCADORES MOLECULARES
650 $aTRIGO
650 $aTRITICUM AESTIVUM
653 $aMAPERO ASOCIATIVO
653 $aPROGRAMA MEJORAMIENTO GENÉTICO DE TRIGO (PMGT)
653 $aQTL
653 $aSELECCIÓN GENÓMICA
700 1 $aLADO, B.
700 1 $aBRANDARIZ, S.
700 1 $aBERRO, I.
700 1 $aGUTIÉRREZ, L.
700 1 $aPEREYRA, S.
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INIA La Estanzuela (LE) |
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