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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
15/03/2022 |
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Actualizado : |
05/10/2022 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
MENA, E.; GARAYCOCHEA, S.; STEWART, S.; MONTESANO, M.; PONCE DE LEÓN, I. |
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Afiliación : |
EILYN MENA, Departamento de Biología Molecular, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable; SILVIA RAQUEL GARAYCOCHEA SOLSONA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVINA MARIA STEWART SONEIRA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARCOS MONTESANO, Departamento de Biología Molecular, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable; INÉS PONCE DE LEÓN, Departamento de Biología Molecular, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. |
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Título : |
Comparative genomics of plant pathogenic Diaporthe species and transcriptomics of Diaporthe caulivora during host infection reveal insights into pathogenic strategies of the genus. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
BMC Genomics, 2022, volume 23, no. 1, 175. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.1186/s12864-022-08413-y |
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ISSN : |
1471-2164 |
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DOI : |
10.1186/s12864-022-08413-y |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 21 October 2021; Accepted 23 February 2022; Published 03 March 2022.
This work was funded by "Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) (grant RTS-1-2014, and graduate fellowship)" Uruguay, "Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA)" Uruguay, and "Programa para Grupo de I + D Comisión Sectorial de Investigación Científica, Universidad de la República", Uruguay.
Author information: Eilyn Mena and Silvia Garaycochea contributed equally to this work.
Supplementary Information: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-022-08413-y#Sec14 |
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Contenido : |
ABSTRACT. - Background: Diaporthe caulivora is a fungal pathogen causing stem canker in soybean worldwide. The generation of genomic and transcriptomic information of this ascomycete, together with a comparative genomic approach with other pathogens of this genus, will contribute to get insights into the molecular basis of pathogenicity strategies used by D. caulivora and other Diaporthe species.
Results: In the present work, the nuclear genome of D. caulivora isolate (D57) was resolved, and a comprehensive annotation based on gene expression and genomic analysis is provided. Diaporthe caulivora D57 has an estimated size of 57,86?Mb and contains 18,385 predicted protein-coding genes, from which 1501 encode predicted secreted proteins. A large array of D. caulivora genes encoding secreted pathogenicity-related proteins was identified, including carbohydrate-active enzymes (CAZymes), necrosis-inducing proteins, oxidoreductases, proteases and effector candidates. |
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Palabras claves : |
Diaporthe pathogens; Effectors; Genomes; Pathogenicity factors; RNAseq; Secretome; Soybean. |
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Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/16809/1/s12864-022-08413-y.pdf
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12864-022-08413-y.pdf
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Marc : |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha actual : |
21/11/2022 |
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Actualizado : |
21/11/2022 |
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Tipo de producción científica : |
Abstracts/Resúmenes |
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Autor : |
OBERTI, H.; REYNO, R.; MURCHIO, S.; GOÑI, C.; DALLA RIZZA, M. |
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Afiliación : |
HÉCTOR OBERTI RVAROLA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RAFAEL ALEJANDRO REYNO PODESTA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARIA SARA MURCHIO VIGNOLO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CAMILA GOÑI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARCO DALLA RIZZA VILARO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Primer borrador del genoma de Paspalum malacophyllum, especie de relevancia como fuente de inmunidad al ergot en el pasto P. dilatatum. [resumen]. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
In: REDBIO México 2022, XI Congreso, "Biotecnología productiva y sostenible". Libro de resúmenes. 12-14 octubre 2022, Yucatán, México. p.20 |
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Idioma : |
Español |
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Notas : |
Este proyecto fue financiado por INIA proyecto BT-19. |
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Contenido : |
Uruguay cuenta con forrajeras nativas C4 que tienen destacada capacidad de adaptación al cambio climático pero con limitaciones en producción de semilla, aspectos sanitarios y en calidad de forraje que afectan aspectos de salud/bienestar animal y las emisiones netas de gases de efecto invernadero. Nuestra hipótesis de trabajo es que el conocimiento genómico de P. malacophyllum contribuirá a desentrañar fuentes de inmunidad reportada en la especie. Más aún, su empleo en el programa de mejoramiento de P. dilatatum contribuirá a levantar las limitantes en producción de semilla y salud animal. |
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Palabras claves : |
Marcadores funcionales; Secuenciación genómica. |
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Thesagro : |
BIOTECNOLOGIA. |
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Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/16864/1/Oberti-H.-REDBIO-Mexico-2022.pdf
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Marc : |
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500 $aEste proyecto fue financiado por INIA proyecto BT-19.
520 $aUruguay cuenta con forrajeras nativas C4 que tienen destacada capacidad de adaptación al cambio climático pero con limitaciones en producción de semilla, aspectos sanitarios y en calidad de forraje que afectan aspectos de salud/bienestar animal y las emisiones netas de gases de efecto invernadero. Nuestra hipótesis de trabajo es que el conocimiento genómico de P. malacophyllum contribuirá a desentrañar fuentes de inmunidad reportada en la especie. Más aún, su empleo en el programa de mejoramiento de P. dilatatum contribuirá a levantar las limitantes en producción de semilla y salud animal.
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