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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas; INIA Treinta y Tres. |
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Fecha : |
05/10/2015 |
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Actualizado : |
11/02/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
BONNECARRERE, V.; QUERO, G.; MONTEVERDE, E.; ROSAS, J.E.; PÉREZ DE VIDA, F.; CRUZ, M.; CORREDOR, E.; GARAYCOCHEA, S.; MONZA, J.; BORSANI, O. |
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Afiliación : |
MARIA VICTORIA BONNECARRERE MARTINEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; GASTON QUERO, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía; ELIANA MONTEVERDE, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía; JUAN EDUARDO ROSAS CAISSIOLS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BLAS PEREZ DE VIDA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARIBEL CRUZ, FLAR (Fondo Latinoamericano para Arroz de Riego); EDGAR CORREDOR, FLAR (Fondo Latinoamericano para Arroz de Riego); SILVIA RAQUEL GARAYCOCHEA SOLSONA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JORGE MONZA, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía; OMAR BORSANI, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía. |
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Título : |
Candidate gene markers associated with cold tolerance in vegetative stage of rice (Oryza sativa L.). |
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Fecha de publicación : |
2015 |
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Fuente / Imprenta : |
Euphytica, 2015, v. 203 no. 2, p. 385-398. |
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Páginas : |
p. 385-398. |
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DOI : |
10.1007/s10681-014-1290-2 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Received: 17 June 2014 / Accepted: 23 October 2014 / Published online: 2 November 2014 |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Low temperature inhibits seedling emergence and early vegetative growth of rice (Oryza sativa L.), especially in cultivars of the subspecies indica, which are the most productive in the temperate region of South America. To improve breeding efficiency, we identified molecular markers associated with cold response related phenotypes, such as membrane integrity, photoinhibition and visual assessment of damage. A candidate gene approach was used to select genomic simple sequence repeat (gSSR) markers. For marker-trait association two strategies were used, candidate gene association mapping (CGAM) and single marker analysis (SMA) in a segregating F2:3 population. Thirty-six gSSR were identified but only 14 were polymorphic in the CGAM population. Using this approach, we found marker RM22034 associated with membrane integrity, RM6547 and RM14978 with photoinhibition, and RM144 with visual assessment of damage. The SMA strategy identified markers RM6651, RM14978, RM22034 and RM4 associated with membrane integrity and RM22034 with photoinhibition. All markers are currently available for marker assisted selection in rice breeding programs located in temperate regions.
© 2014, Springer Science+Business Media Dordrec |
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Palabras claves : |
ASOCIACIÓN DE MARCADORES; CANDIDATE GENE; COLD TOLERANCE; GEN CANDIDATO; MARCADOR DE RASGO; MARKER-TRAIT ASSOCIATION; REPETICIONES DE SECUENCIAS SIMPLES (SSR); RICE (ORYZA SATIVA L.); SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR) MARKER V. |
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Thesagro : |
ARROZ; MARCADORES MOLECULARES; TOLERANCIA AL FRIO. |
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Asunto categoría : |
--
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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| Registros recuperados : 91 | |
| 61. |  | MONTEVERDE, E.; ROSAS, J.E.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; BONNECARRERE, V.; QUERO, G.; GUTIERREZ, L.; MCCOUCH, S. Multienvironment models increase prediction accuracy of complex traits in advanced breeding lines of rice (O. sativa). Crop Science, 2018, 58:1519-1530. Article history: Accepted on May 09, 2018. Published online June 21, 2018.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 63. | | MOLINA, F.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; MARTINEZ, S.; BONNECARRERE, M.; ROSAS, J.; PEREIRA, A.; CARRACELAS, G. Parao : nueva opción productiva "Arroz (ACA); 2013, v. 15, no. 74, p. 38-40"| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 65. | | ROSAS, J.E.; SPRUNCK, B.; IRIARTE, W.; REBOLLO, I.; BONNECARRERE, V.; MOLINA, F.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F. Validación de SNP asociados a variables de interés en germoplasma Japónica tropical de INIA. In: Terra, J. A.; Martínez, S.; Saravia, H. (Eds.) Arroz 2019. Montevideo (UY): INIA, 2019. p. 89-92. (INIA Serie Técnica; 250)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 66. | | REBOLLO, I.; SCHEFFEL, S.; BLANCO, P.H.; MOLINA, F.; MARTÍNEZ, S.; CARRACELAS, G.; AGUILAR, I.; PÉREZ DE VIDA, F.; ROSAS, J.E. Consolidating twenty-three years of historical data from an irrigated subtropical rice breeding program in Uruguay. Crop Science, 2023. https://doi.org/10.1002/csc2.20955 - [Article in Press]. Article history: First published 15 March 2023. -- Corresponding author: jrosas@inia.org.uy --| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 67. | | BONNECARRERE, V.; GARAYCOCHEA, S.; GUTIERREZ, L.; ROSAS, J.E.; BERBERIAN, N.; FERNÁNDEZ, S.; MARTÍNEZ, S.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H. Avances de resultados del proyecto mapeo asociativo para la identificación de marcadores asociados a rendimiento, calidad y resistencia a enfermedades In: PROGRAMA NACIONAL PRODUCCIÓN DE ARROZ; JORNADA ANUAL ARROZ-SOJA, 2013, INIA TREINTA Y TRES, UY. Arroz-soja: resultados experimentales 2012-2013. Treinta y Tres: INIA, 2013. "cap. 6; p. 22-24" (INIA Serie Actividades de Difusión ; 713)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó; INIA Treinta y Tres. |
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| 68. | | BONNECARRERE, M.; ROSAS, J.; DIEZ, M.; CASTILLO, A.; GARAYCOCHEA, S.; MARTÍNEZ, S.; PÉREZ DE VIDA, F.; SALDAIN, N.E.; BLANCO, P.H. La Biotecnología en el campo: el ejemplo del arroz. ln: Jornada técnica, VI Jornada de agrobiotecnología. INIA Las Brujas, 20 de octubre de 2012 Conocimiento intensivo para el sector productivo: situación actual y perspectivas. Canelones (UY): INIA, 2012. 19-22 (Serie Actividades de Difusión; 698)| Tipo: Actividades de Difusión |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 69. | | BONNECARRERE, V.; QUERO, G.; MONTEVERDE, E.; ROSAS, J.E.; PÉREZ DE VIDA, F.; CRUZ, M.; CORREDOR, E.; GARAYCOCHEA, S.; MONZA, J.; BORSANI, O. Candidate gene markers associated with cold tolerance in vegetative stage of rice (Oryza sativa L.). Euphytica, 2015, v. 203 no. 2, p. 385-398. p. 385-398. Received: 17 June 2014 / Accepted: 23 October 2014 / Published online: 2 November 2014| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Treinta y Tres. |
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| 70. | | BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; MOLINA, F.; AVILA, S.; LAVECCHIA, A.; BONNECARRERE, V.; SILVERA, W.; ROSAS, J.E.; ARISMENDI, N. Comentarios generales sobre la evaluación interna de cultivares. ln: INIA TREINTA Y TRES. Arroz: Resultados experimentales 2009-2010. Treinta y Tres (Uruguay): INIA, 2010. cap. 7, p. 11-15 (INIA Serie Actividades de Difusión; 611)| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 71. | | BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; MOLINA, F.; LAVECCHIA, A.; MARCHESI, C.; BONNECARRERE, V.; MARTINEZ, S.; SILVERA, W.; ROSAS, J.E.; ARISMENDI, G.; CASALES, L.; ESCALANTE, F. Comentarios generales sobre la evaluación interna de cultivares. ln: INIA TREINTA Y TRES. Arroz : Resultados experimentales 2010-2011. Treinta y Tres (Uruguay): INIA, 2011. C. 6 p. 3-5. (INIA Serie Actividades de Difusión; 651)| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 72. | | ROSAS, J.E.; MARTÍNEZ, S.; BONNECARRERE, M.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H.; MALOSETTI, M.; JANNINK, J.L.; GUTIÉRREZ, L. Comparison of phenotyping methods for resistance to stem rot and aggregated sheath spot in rice. Crop Science, 2016, v. 56, no. 4, p. 1619-1627. Open Access Article history: Published June 15, 2016.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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| 73. | | ROSAS, J.E.; BONNECARRERE, V.; MARTÍNEZ, S.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H.; QUERO, G.; FERNANDEZ, S.; GARAYCOCHEA, S.; JANNINK, J.L.; GUTIÉRREZ, L. GWAS for resistance to stem rot and aggregated sheath spot in advanced temperate rice (Oryza sativa L.) germplasm. [Poster]. In: International Conference on Quantitative Genetics, (5o., 2016, Madison)| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 74. | | ROSAS, J.E.; MARTÍNEZ, S.; BONNECARRERE, V.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H.; FERNANDEZ, S.; GARAYCOCHEA, S.; JANNINK, J.L.; GUTIERREZ, L. GWAS for resistance to stem rot and aggregated sheath spot of rice advanced breeding lines. [Poster]. In: International Symposium on Rice Functional Genomics, (14o., 2016, Montpellier),| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 75. | | ROSAS, J.E.; MARTÍNEZ, S.; BONNECARRERE, V.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; GERMAN, S.; JANNINK, J.L.; GUTIÉRREZ, L. Herramientas bioestadísticas para mejoramiento de la resistencia genética a enfermedades del tallo en arroz. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Biotecnología. Jornada de Agrobiotecnología, X. Encuentro Nacional de REDBIO, II. Jornada técnica. Las Brujas, Canelones (UY): INIA, 2017. p. 9-12. (Serie Actividades de Difusión; 780)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 76. | | QUERO, G.; GUTIÉRREZ, L.; FERNANDEZ, S.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; GARAYCOCHEA, S.; MONTEVERDE, E.; MCCOUCH, M.; ROSAS, J.E.; BERBERIAN, N.; SIMONDIS, S.; BONNECARRERE, V. Genome wide association (GWAS) discovers rice granin quality genes in the starch metabolism, grain size and cell wall synthesis pathways. MV 24 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 292| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
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| 77. | | MONTEVERDE, E.; BLANCO, P.H.; BONNECARRERE, V.; GUTIÉRREZ, L.; ROSAS, J.E.; QUERO, G.; BARBERIÁN, N.; GARAYCOCHEA, S.; FERNANDEZ, S.; MCCOUCH, S. Implementing Genomic Selection in a temperate Rice Breeding Program. [P0716] In: International Plant & Animal Genome, Conference PAG XXIV, "The largest Ag-genomics Meeting in the World San Diego, CA, USA; January 9-13, 2016. [Abstract]| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
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| 78. | | ROSAS, J.E.; MARTÍNEZ, S.; BONNECARRERE, V.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; GERMAN, S.; JANNINK, J.L.; GUTIÉRREZ, L. Evaluación de nuevos métodos de selección para resistencia a enfermedades del tallo y la vaina en arroz. In: Zorrilla, G.; Martínez, S.; Saravia, H. (Eds.) Arroz 2017. Montevideo (UY): INIA, 2017. p. 31-34. (INIA Serie Técnica; 233)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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| 79. | | ROSAS, J.E.; BONNECARRERE, V.; MARTÍNEZ, S.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H.; QUERO, G.; FERNANDEZ, S.; GARAYCOCHEA, S.; JANNINK, J.; GUTIERREZ, L. Mapeo asociativo de la resistencia a enfermedades del tallo y la vaina en germoplasma avanzado de arroz. 2 - SIMPOSIOS "MEJORAMIENTO GENÉTICO POR RESISTENCIA A ENFERMEDADES E INTERACCIONES PLANTA-PATÓGENO" In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 61| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
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| 80. | | BONNECARRERE, M.; QUERO, G.; ROSAS, J.E.; FERNANDEZ, S.; GARAYCOCHEA, S.; MARTÍNEZ, S.; PÉREZ DE VIDA, F.; BLANCO, P.H.; BERBERIAN, N.; GUTIERREZ, L. Marcadores moleculares identificados en el Proyecto "Mapeo asociativo para asistir el mejoramiento genético de arroz". In: JORNADA TÉCNICA, VIII JORNADA DE AGROBIOTECNOLOGÍA. INIA LAS BRUJAS, 30 DE OCTUBRE DE 2014. UNIDAD DE BIOTECNOLOGÍA. Montevideo (Uruguay): INIA, 2014. 5-6 (Actividades de Difusión; 741)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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