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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
07/10/2022 |
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Actualizado : |
27/04/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
GARCÍA, A.; AGUILAR, I.; LEGARRA, A.; TSURUTA, S.; MISZTAL, I.; LOURENCO, D. |
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Afiliación : |
ANDRÉ GARCÍA, Department of Animal and Dairy Science, University of Georgia, Athens, 30602, GA, United States; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANDRÉS LEGARRA, INRA Toulouse, Castanet Tolosan, 31326, France; SHOGO TSURUTA, Department of Animal and Dairy Science, University of Georgia, Athens, 30602, GA, United States; IGNACY MISZTAL, Department of Animal and Dairy Science, University of Georgia, Athens, 30602, GA, United States; DANIELA LOURENCO, Department of Animal and Dairy Science, University of Georgia, Athens, 30602, GA, United States. |
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Título : |
Theoretical accuracy for indirect predictions based on SNP effects from single-step GBLUP. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
Genetics, Selection, Evolution : GSE, 2022, Volume 54, Issue 1, Pages 66. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.1186/s12711-022-00752-4 |
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ISSN : |
1297-9686 |
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DOI : |
10.1186/s12711-022-00752-4 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 22 March 2022; Accepted 23 August 2022; Published 27 September 2022. |
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Contenido : |
ABSTRACT. - BACKGROUND: Although single-step GBLUP (ssGBLUP) is an animal model, SNP effects can be backsolved from genomic estimated breeding values (GEBV). Predicted SNP effects allow to compute indirect prediction (IP) per individual as the sum of the SNP effects multiplied by its gene content, which is helpful when the number of genotyped animals is large, for genotyped animals not in the official evaluations, and when interim evaluations are needed. Typically, IP are obtained for new batches of genotyped individuals, all of them young and without phenotypes. Individual (theoretical) accuracies for IP are rarely reported, but they are nevertheless of interest. Our first objective was to present equations to compute individual accuracy of IP, based on prediction error covariance (PEC) of SNP effects, and in turn, are obtained from PEC of GEBV in ssGBLUP. The second objective was to test the algorithm for proven and young (APY) in PEC computations. With large datasets, it is impossible to handle the full PEC matrix, thus the third objective was to examine the minimum number of genotyped animals needed in PEC computations to achieve IP accuracies that are equivalent to GEBV accuracies. © 2022. The Author(s). |
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Palabras claves : |
Algorithm; Breeding; Covariance; Prediction error; Single nucleotide polymorphism. |
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Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/16814/1/s12711-022-00752-4.pdf
https://gsejournal.biomedcentral.com/counter/pdf/10.1186/s12711-022-00752-4.pdf
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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Fecha actual : |
21/02/2014 |
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Actualizado : |
09/08/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Trabajos en Congresos/Conferencias |
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Autor : |
REAL, D.; REYNO, R.; DALLA RIZZA, M.; ALTIER, N.; DO CANTO, J.; NARANCIO, R.; FOLLE, G.; BURGUEÑO, J. |
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Afiliación : |
DANIEL REAL FERREIRO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RAFAEL ALEJANDRO REYNO PODESTA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARCO DALLA RIZZA VILARO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; NORA ADRIANA ALTIER MANZINI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JAVIER DO CANTO FAGUNDEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RAFAEL NARANCIO FERES, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; GUSTAVO FOLLE, MEC/ IIBCE (Instituto de Investigaciones de Ciencias Biológicas "Clemente Estable").; JUAN BURGUEÑO, CIMMYT, México. |
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Título : |
Caracterización de genotipos de Paspalum notatum por tolerancia a bajas temperaturas y reacción frente a Claviceps paspali |
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Fecha de publicación : |
2008 |
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Fuente / Imprenta : |
ln: Reunión del grupo técnico en forrajeras del Cono Sur, 22., 2008, Minas, Uruguay Bioma campos: innovando para mantener su sustentabilidad y competitividad. Memorias. Minas (Uruguay): INIA; FAO; PROCISUR, 2008. |
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Páginas : |
p. 156 |
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Idioma : |
Español |
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Notas : |
Versión impresa y en CD ROM Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay; FAO; PROCISUR |
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Contenido : |
Paspalum notatum Flügge es una de las gramíneas nativas que predominan en los tapices naturales del Uruguay. Ha sido mejorada genéticamente en otros países donde existen varios cultivares. Es cultivada como forrajera en extensas áreas, principalmente.en EUA. En el200G se realizó una colecta
en Uruguay buscando valorizar y caracterizar la variabilidad genética y fenotípica de la especie. En el otoño de 2008 se determinó la incidencia de Claviceps paspali en las accesiones colectadas. También se transplantaron a campo clones de 10 de las accesiones colectadas, 5 cultivares de EUA y 5 cruzamientos de genotipos nativos con materiales selectos argentinos, con el objetivo de evaluar estos materiales por resistencia a bajas temperaturas. Se hizo una caracterización molecular en la que se usaron marcadores ISSR y se determinó el nivel de ploidía mediante cítometría de flujo. Se identificaron
plantas sanas y plantas afectadas con distinta severidad que serán evaluadas posterioiTl1ente en distintos ambientes para detenninar si las diferencias se deben a factores genéticos. La evaluación por tolerancia a bajas temperaturas permitirá identificar accesiones superiores en esta característica.
Los resultados que se obtengan detel111inarán la pertinencia de realizar cruzamientos entre materiales nativos con resistencia a C. paspali y a bajas temperaturas, con cultivares de alta productividad, con el fin de obtener líneas que combinen estas características. |
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Palabras claves : |
BAJAS TEMPERATURAS; CLAVICEPS PASPALI; PASPALUM NOTATUM. |
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Thesagro : |
LEGUMINOSAS FORRAJERAS; PLANTAS FORRAJERAS. |
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Asunto categoría : |
--
A50 Investigación agraria |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/1110/1/18429090512095530.pdf
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/13069/1/Reyno-2008.pdf
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Marc : |
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520 $aPaspalum notatum Flügge es una de las gramíneas nativas que predominan en los tapices naturales del Uruguay. Ha sido mejorada genéticamente en otros países donde existen varios cultivares. Es cultivada como forrajera en extensas áreas, principalmente.en EUA. En el200G se realizó una colecta en Uruguay buscando valorizar y caracterizar la variabilidad genética y fenotípica de la especie. En el otoño de 2008 se determinó la incidencia de Claviceps paspali en las accesiones colectadas. También se transplantaron a campo clones de 10 de las accesiones colectadas, 5 cultivares de EUA y 5 cruzamientos de genotipos nativos con materiales selectos argentinos, con el objetivo de evaluar estos materiales por resistencia a bajas temperaturas. Se hizo una caracterización molecular en la que se usaron marcadores ISSR y se determinó el nivel de ploidía mediante cítometría de flujo. Se identificaron plantas sanas y plantas afectadas con distinta severidad que serán evaluadas posterioiTl1ente en distintos ambientes para detenninar si las diferencias se deben a factores genéticos. La evaluación por tolerancia a bajas temperaturas permitirá identificar accesiones superiores en esta característica. Los resultados que se obtengan detel111inarán la pertinencia de realizar cruzamientos entre materiales nativos con resistencia a C. paspali y a bajas temperaturas, con cultivares de alta productividad, con el fin de obtener líneas que combinen estas características.
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Registro original : |
INIA Tacuarembó (TBO) |
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