| |
|
|
|
Registro completo
|
|
Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
|
Fecha : |
13/03/2020 |
|
Actualizado : |
13/03/2020 |
|
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
|
Autor : |
BRANDA, A.; NICOLINI, P.; FEDERICI, M.; LLAMBÍ, S. |
|
Afiliación : |
ANDREA BRANDA SICA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI, Universidad de La República, Centro Universitario de Tacuarembó, Instituto Superior de la Carne, Área Biología Molecular; MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA LLAMBÍ, Universidad de La República. Facultad de Veterinaria, Sección Genética. |
|
Título : |
Identification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.] |
|
Fecha de publicación : |
2019 |
|
Fuente / Imprenta : |
Archives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494 |
|
ISSN : |
1517-784X |
|
DOI : |
10.5380/avs.v24i4.65494 |
|
Idioma : |
Inglés |
|
Notas : |
Article history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019.
Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy |
|
Contenido : |
ABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. MenosABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agr... Presentar Todo |
|
Palabras claves : |
Curvas de dissociaçãode alta resolução; CVM; High-resolution dissociation curve. |
|
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
|
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14303/1/Branda-A.-2019.-Archives-of-Veterinary-Science.pdf
https://revistas.ufpr.br/veterinary/article/download/65494/40219
|
|
Marc : |
LEADER 03306naa a2200229 a 4500
001 1060918
005 2020-03-13
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1517-784X
024 7 $a10.5380/avs.v24i4.65494$2DOI
100 1 $aBRANDA, A.
245 $aIdentification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.]$h[electronic resource]
260 $c2019
500 $aArticle history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019. Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy
520 $aABSTRACT. The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs. RESUMO. O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética.
653 $aCurvas de dissociaçãode alta resolução
653 $aCVM
653 $aHigh-resolution dissociation curve
700 1 $aNICOLINI, P.
700 1 $aFEDERICI, M.
700 1 $aLLAMBÍ, S.
773 $tArchives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
|
Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
|
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
|
|
| Registros recuperados : 64 | |
| 1. |  | DOCAMPO, R. El análisis foliar Montevideo (Uruguay): INIA, 1996. 2 p. (Hoja de Divulgación ; 44)| Tipo: Hojas de Divulgación |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
|    |
| 2. | | DOCAMPO, R. Compostaje y compost. Revista INIA Uruguay, 2013, no. 35, p. 63-67. (Revista INIA; 35)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
| 3. | | DOCAMPO, R. Fertilización. In: GROMPONE, M.A.; VILLAMIL, J. (Coord.). Aceites de oliva: de la planta al consumidor: volumen 1. Montevideo, UY: Hemisferio Sur/INIA, 2013. p. 141-155 Volumen 1 de dos volúmenes| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
| |
| 6. | | Docampo, R. Importancia de la nutrición mineral del olivo ln: "Programa Nacional de Investigación en Producción Frutícola; INIA Las Brujas". Resultados experimentales en olivos. Jornada de divulgación. Canelones (Uruguay): INIA Las Brujas, 2010. p. 33-40 (INIA Serie Actividades de Difusión; 626) "Programa Nacional de Investigación en Producción Frutícola; INIA Las Brujas"| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
| 11. | | DOCAMPO, R. Planificación del riego Montevideo (Uruguay): INIA, 1998. 3 p. (Hoja de Divulgación ; 65)| Tipo: Hojas de Divulgación |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
| 15. | | DOCAMPO, R. Pautas para el manejo de la materia orgánica In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Hortícola. Resultados experimentales en el cultivo del tomate. Jornada anual. Canelones (Uruguay): INIA Las Brujas, 2009. p. 11-14 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 574)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
|  |
| 19. | | DOCAMPO, R.; CABRERA, D. Manejo de suelos. ln: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria). Programa Fruticultura. Tecnología disponible para la producción de durazneros en la zona norte del país. Jornada de divulgación (Canelones, 9 junio 1994). Canelones (UY): INIA Las Brujas, 1994. p. 7-11 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 16)| Tipo: Actividades de Difusión |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
| |
| Registros recuperados : 64 | |
|
| Expresión de búsqueda válido. Check! |
|
|
