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Biblioteca (s) :  INIA Las Brujas.
Fecha :  28/07/2023
Actualizado :  28/07/2023
Tipo de producción científica :  Artículos en Revistas Indexadas Internacionales
Autor :  RODRÍGUEZ, J.D.; PERIPOLLI, E.; LONDOÑO-GIL, M.; ESPIGOLAN, R.; LÔBO, R. B.; LÓPEZ-CORREA, R.; AGUILAR, I.; BALDI, F.
Afiliación :  JUAN DIEGO RODRÍGUEZ, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.; ELISA PERIPOLLI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; MARISOL LONDOÑO-GIL, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; RAFAEL ESPIGOLAN, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Departamento de Medicina Veterinária, Universidade de São Paulo (Usp), Pirassununga, 13535-900, Brazil.; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, Ribeirão Preto, Brazil; RODRIGO LÓPEZ-CORREA, Facultad de Veterinaria, Departamento de Genética y Mejoramiento Animal, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BALDI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.
Título :  Effect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population.
Complemento del título :  Research paper.
Fecha de publicación :  2023
Fuente / Imprenta :  Animal Production Science. 2023, volume 63, issue 9, p. 844-852. https://doi.org/10.1071/AN21581
ISSN :  1836-0939; eISSN: 1836-5787.
DOI :  10.1071/AN21581
Idioma :  Inglés
Notas :  Article history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023, Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br -- Handling Editor: Kim Bunter. --
Contenido :  Context: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes. Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population. © 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing
Palabras claves :  Bias; Bovine; Customised SNP arrays; Genomic selection; Imputation accuracy; Inflation; MAF; Simulation.
Asunto categoría :  L10 Genética y mejoramiento animal
Marc :  Presentar Marc Completo
Registro original :  INIA Las Brujas (LB)
Biblioteca Identificación Origen Tipo / Formato Clasificación Cutter Registro Volumen Estado
LB103624 - 1PXIAP - DDANIMAL PRODUCTION SCIENCE/2023

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1.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I. Tras el valor objetivo de mérito genético. Revista Ganadería (ARU), 2015, v.143 (148), p.64-68.
Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela.
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2.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I.; MISZTAL, I. Technical Note: Recursive Algorithm for Inbreeding Coefficients Assuming Nonzero Inbreeding of Unknown Parents. Journal of Dairy Science, 2008, 91 (4): 1669-1672. Article history: Received August 3, 2007. // Accepted December 17, 2007.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : A - 1
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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3.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I.; TSURUTA, S.; MISZTAL, I. Computing options for multiple-trait test-day random regression models while accounting for heat tolerance. Journal of Animal Breeding and Genetics, 2010, v.127, no.3, p.235-241. Article history: Received: 24 December 2008 / Accepted: 08 September 2009.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : A - 2
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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4.Imagen marcada / sin marcar MISZTAL, I.; LEGARRA, A.; AGUILAR, I. Computing procedures for genetic evaluation including phenotypic, full pedigree, and genomic information. Journal of Dairy Science, 2011, 92 (9): 4648-4655. OPEN ACCESS. Article history: Received January 26, 2009. // Accepted April 29, 2009.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : A - 1
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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5.Imagen marcada / sin marcar QUEZADA, M.; BALMELLI, G.; AGUILAR, I. Aplicación de modelos de Selección Genómica Single Step en Eucalyptus globulus. [Resumen] In: REDBIO; INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); REDBIO Argentina. X Encuentro Latinoamericano y del Caribe de Biotecnología Agropecuaria y XI Simposio Redbio Argentina. Libro de Resúmenes. Montevideo 12 - 15 Noviembre 2019. Montevideo (UY): INIA, 2019. p. 122. (INIA Serie Técnica; 253)
Tipo: Abstracts/Resúmenes
Biblioteca(s): INIA Tacuarembó.
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6.Imagen marcada / sin marcar FORNI, S.; AGUILAR, I.; MISZTAL, I. Different genomic relationship matrices for single-step analysis using phenotypic, pedigree and genomic information. Genetics Selection Evolution, 2011, v.43, no.1, p.443-447. ARTICULO OPEN ACCESS.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : A - 2
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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7.Imagen marcada / sin marcar REBOLLO, I.; AGUILAR, I.; ROSAS, J.E. Comparison of conventional and GBLUP Genome-Wide Association mapping of cold tolerance in advanced rice breeding populations. [Abstract] + [Poster]. In: International Temperate Rice Conference (7., 2020, Pelotas, RS), Science & Innovation: feeding a world of 10 billion people: proceedings. Pelotas RS, Brasil, February 9-12, 2020. Brasília, DF : Embrapa, 2020.
Tipo: Abstracts/Resúmenes
Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres.
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8.Imagen marcada / sin marcar DARTAYETE, A.; AGUILAR, I.; GIMENO, D. Estimation of heritabilities and genetic correlations between weights and carcass traits in beef cattle in Uruguay. [764]. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 11., Aotea Centre Auckland, New Zealand: WCGALP, ICAR, 11-16 feb 2018.
Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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9.Imagen marcada / sin marcar REBOLLO, I.; AGUILAR, I.; ROSAS, J.E. Genética de la respuesta a temperatura y radiación en etapa reproductiva en germoplasma de arroz de INIA. In: Terra, J. A.; Martínez, S.; Saravia, H.; Mesones, B. (Eds.) Arroz 2021. Montevideo (UY): INIA, 2022. p. 95-98. (INIA Serie Técnica; 262)
Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico
Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres.
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10.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I.; MISZTAL, I.; TSURUTA, S. Genetic components of heat stress for dairy cattle with multiple lactations. Journal of Dairy Science, 2009, v. 92, no. 11, p. 5702-5711.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : A - 1
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas.
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11.Imagen marcada / sin marcar GOLDBERG, V.; CIAPPESONI, C.; AGUILAR, I. Genetic parameters for nematode resistance in periparturient ewes and post-weaning lambs in Uruguayan Merino sheep. Livestock Science, 2012, v.147, no.1-3, p.181-187. Article history: Received 14 December 2011 / Received in revised form 2 May 2012 / Accepted 3 May 2012.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : B - 1
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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12.Imagen marcada / sin marcar QUEZADA, M.; AGUILAR, I.; BALMELLI, G. Genomic breeding values' prediction including populational selfing rate in an open-pollinated Eucalyptus globulus breeding population. Tree Genetics and Genomes, 2022, Volume 18, Issue 2, Article number 10. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.1007/s11295-021-01534-7 Article history: Received 14 May 2021; Revised 17 November 2021; Accepted 27 November 2021; Published 07 February 2022. -- Electronic supplementary material. -- Corresponding author: Balmelli, G.; Instituto Nacional de Investigación...
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : Internacional - --
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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13.Imagen marcada / sin marcar REBOLLO, I.; ROSAS, J.E.; AGUILAR, I. Efficient computation of the additive relationship matrix and its inverse in self-breeding individuals. In: International Conference on Quantitative Genetics 6, 2020, Brisbane, Australia, (virtual).
Tipo: Abstracts/Resúmenes
Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres.
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14.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I.; RAVAGNOLO, O.; PRAVIA, M.I. Evaluación genética poblacional raza Braford. ln: Bemhaja, M.; Pittaluga, O., eds. 30 años de investigación en suelos de areniscas, INIA Tacuarembó. Montevideo (Uruguay): INIA, 2006. p. 83-89 (INIA Serie Técnica ; 159)
Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico
Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó.
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15.Imagen marcada / sin marcar AGUILAR, I.; RAVAGNOLO, O.; PRAVIA, M.I. Evaluación genética poblacional raza Braford. Unidad Experimental La Magnolia, 3 abril, 2009. ln: INIA TACUAREMBÓ. Soluciones tecnológicas para la raza Braford: gira técnica. En el marco del CONGRESO MUNDIAL BRAFORD, 4., Punta del Este, Uruguay, 2009. Tacuarembó: INIA, 2009. p. 42-44.
Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias
Biblioteca(s): INIA Tacuarembó.
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16.Imagen marcada / sin marcar GOLDBERG, V.; CIAPPESONI, G.; AGUILAR, I. Modelling the faecal worm egg count curve during the periparturient period in Uruguayan Merino sheep. [Modelación de la curva del recuento de huevos de parásitos durante el período del periparto en ovinos Merino uruguayo.] Spanish Journal of Agricultural Research, 2012, v.10, no.4, p. 986-992. Article history: Received: 21 June 2012. / Accepted: 08 November 2012.
Tipo: Artículos en Revistas Indexadas InternacionalesCirculación / Nivel : B - 1
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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17.Imagen marcada / sin marcar VITEZICA, Z. G; AGUILAR, I.; LEGARRA, A. One-step vs. multi-step methods for genomic prediction in presence of selection. Volume Genetic improvement programmes: Selection using molecular information - Lecture Sessions, 0131. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 9., Leipzig, Germany, August 1-6, 2010. p. 0131. This work has been partly financed by ANR project AMASGEN. Project partly supported by Toulouse MidiPyrénées bioinformatic platform.
Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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18.Imagen marcada / sin marcar SILVEIRA, N.F.; RAVAGNOLO, O.; AGUILAR, I. Longevity in genetic evaluation of Holstein cows in Uruguay. [664]. Part 37 - Bovine dairy - genetic evaluation methods. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), 12., Rotterdam, the Netherlands, 3-8 July 2022. doi: https://doi.org/10.3920/978-90-8686-940-4_664 2741-2744. Article history: Published online: February 9, 2023. -- Corresponding author: N.F. Silveira, email: nferraz@inia.org.uy
Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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19.Imagen marcada / sin marcar ROMÁN, L.; LA MANNA, A.; AGUILAR, I. Principales resultados de investigación en estrés calórico en vacas lecheras. Revista INIA Uruguay, n. 43, p. 29-30, 2015.
Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Tacuarembó.
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20.Imagen marcada / sin marcar LEMA, O.M.; RAVAGNOLO, O.; AGUILAR, I. Programa nacional de mejoramiento genético en bovinos para carne. [Resumen]. In: Simposio Internacional de Recursos Genéticos para las Américas y el Caribe [SIRGEAC], 12. Resúmenes. Rocha (Uruguay): CURE, 2019. s.p.
Tipo: Abstracts/Resúmenes
Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres.
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