Fecha/hora: 16/06/2024 02:39:27

Biblioteca(s): | INIA Las Brujas.
Fecha corriente: | 28/07/2023
Fecha de la última actualización: | 28/07/2023
Autoria: | RODRÍGUEZ, J.D.; PERIPOLLI, E.; LONDOÑO-GIL, M.; ESPIGOLAN, R.; LÔBO, R. B.; LÓPEZ-CORREA, R.; AGUILAR, I.; BALDI, F.
Afiliación: | JUAN DIEGO RODRÍGUEZ, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.; ELISA PERIPOLLI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; MARISOL LONDOÑO-GIL, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; RAFAEL ESPIGOLAN, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Departamento de Medicina Veterinária, Universidade de São Paulo (Usp), Pirassununga, 13535-900, Brazil.; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, Ribeirão Preto, Brazil; RODRIGO LÓPEZ-CORREA, Facultad de Veterinaria, Departamento de Genética y Mejoramiento Animal, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BALDI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.
Título: | Effect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population.
Complemento del título: | Research paper.
Año de publicación: | 2023
Fuente/Imprenta: | Animal Production Science. 2023, volume 63, issue 9, p. 844-852. https://doi.org/10.1071/AN21581
ISSN: | 1836-0939; eISSN: 1836-5787.
DOI: | 10.1071/AN21581
Idioma: | Inglés

Notas:

Article history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023,  Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez, 
Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br  -- Handling Editor: Kim Bunter. --

Contenido:

Context: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes.
Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population.
© 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing

Palabras-Clave: | Bias; Bovine; Customised SNP arrays; Genomic selection; Imputation accuracy; Inflation; MAF; Simulation.
Categoría del tema: | L10 Genética y mejoramiento animal
Registro original: | INIA Las Brujas (LB)
Ejemplares: | LB - (103624-1) - PXI - AP - DD - ANIMAL PRODUCTION SCIENCE/2023 -  -  - DIS